EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05640 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:5377319-5378467 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr18:5378041-5378052TATTGTTTATT-6.62
NFYAMA0060.3chr18:5378240-5378251TCTGATTGGCT+6.32
ZNF143MA0088.2chr18:5378423-5378439TTCCCACAATGCACTG-8.63
Enhancer Sequence
GCTTTCAGAG AAAGGAAGTC AAGATGTAGA ATGGCCCACC CAATCACCTG ACTTTAATCC 60
AATAGAAAAT ACAAAATAAA GATCAGAATT GATAGACGAG ACCCNNNNNN NNNNNNNNNN 120
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 180
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNACACAC ACATACACCA CACACACACA CATACAGAAA 240
CACACAAACA GAAACTAATA TATTCATTTA TGTGTGTGTG TATTATCTGT GTGTGTGTGT 300
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATTATGTGTT TATGTGTGTG TATTGTATGT GTGTATATTG 360
TGTGGATTAT GTGTGTGTAT TACTTGAGTG TATTATGTGT TTGTGTGTAT ATTGTGTGTG 420
TCTGTGTGTT ATGTCTGTGT GTGTGTTTAT GTGTGTGTGT GTTATGTGTG TATTATGTGT 480
TTATGTGTGT ATATTGTGTG TGTGTGTGTG TCTGTGTGTT ATGTCTGTGT GTGCTTATGT 540
GTGTGTGTGT TATGTGTGTA TTGTGTGTGT GTTATGTCTG TGTGTTATGT CTGTGTGTGT 600
TTATGGGGGG GGGTGTGTGT TATGTGTGTA TTATGTGTTT AGGTGTGTAT ATTGTGTGTG 660
TGTGTGTGTG TGTGTATTAT GTGTTTATGT GTGTGTATTG TATGTGTGTA TGTGTGTGTG 720
TGTATTGTTT ATTATATGTA TATGTGTGTA TATTGTGTAT TATATGTGTG TGTGTGTGTG 780
TGTGTAGGGT GTGACGCTGA CCTCCGCTAT CGGTGGAGCA GATATGCCGG TGGTGATCAC 840
GGTGTTGAAC AGTTACTCCG GCTGGGCTCT GTGTGCTGAG GGGTTCCTGC TGGAAAACAA 900
CCTGATGACC ATCGTCGGCG CTCTGATTGG CTCGTCAGGC GCCATCCTGT CCTACATCAT 960
GTGTGTGGTG AGTGAACGCC GGTGGGGGTG GAGCTGAAGG GTGTGTCTTA ATCTGCACCC 1020
TTGCTCGCTA GTCAGTGCAC AGATCGGAGA GTCAGTCAGT CACTGAATCC TTCCACTGCA 1080
CTTAATGTTC ATGTGCTTAA AAATTTCCCA CAATGCACTG TGAAAGTCAG GGCGCATCGA 1140
TACACACT 1148