EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05634 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:4636862-4638764 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr18:4637537-4637558AAAAAAAAACAAAAAGCAAAA-6.07
LEF1MA0768.1chr18:4638646-4638661GAACCTTTGATCTCT-6.15
SOX10MA0442.2chr18:4637512-4637523AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr18:4637701-4637712AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr18:4637901-4637912AAAACAAAGCA+6.02
TCF7L1MA1421.1chr18:4638649-4638661CCTTTGATCTCT-6.44
Tcf7MA0769.1chr18:4638649-4638661CCTTTGATCTCT-6.44
ZNF384MA1125.1chr18:4636936-4636948TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr18:4636935-4636947TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr18:4636934-4636946TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAAAGCATAG CTGCTTATGA GGCCGTTCAC ATATTGTGTC TTTTGCGCAC AGGAGCACAT 60
ATTATAAGTA CATTTAAAAA AAAAAAGAGT GAATGATCGA GGCGAACAAA ACCAAGCAAT 120
CCAAAACACA AAAACAAAAC AAAACAACAA AACAAACAGC AAAAAACACA GCTAAGCGAA 180
GAGAAACTAA ACAAAACATA AAGCGAAGCA AAGCAAAAAC AAATAAAAAA AGCAAAGCAG 240
AACAAAGCAA AGCAAAGCAA AAAACAAATA AAAAAATAAA GCAACGCAAA ATAAAGTAAA 300
ACGAAATGAA ACATAAAACA AAAGCAAAGC AAATCAAAAC ACAAATAAAA AAGCAAAACA 360
GATCAAAGCA ATGCAAAGCA AAACAAAACG AAATGAAACA CAAAACAAAA GCAAAGCAAA 420
ACAAAACACA AAACAAACCA AAACAAACAA GACAAAGTAA AGCAAAGCAA AAATAAAAAA 480
TAACTACTCA TAACATAAAT AATTAAAAAT CCATATTATA TTCAAATAAA AAAGCAAAGC 540
AAAGCAAAGC AAAACAAAAC ACAGCAAAAC AAAAGCTAAG CAAAGCCAAG CAAAAGCAGA 600
GTAGAGTAGA GCAGAGCAAA GCAAGATGAA ACACAAAACC AAATTAAAGC AAAACAAAGC 660
AAAGCAAAGT AACAGAAAAA AAAACAAAAA GCAAAAAAAA AAACAGCTAA GTGAAGAGAA 720
ACTAAACAAA ACAAAAAGCA AAGCAAAGTA ATGAAATACA AAGCAATACA AAGCAAACAA 780
AACAAAACAA TACAAAAGCA AAGCAAAGCA AGGCGAAACA AAGCTACAAA AAACGAAACA 840
AAACAAAGCA AAATGAAATG TAACACAAAA GCAAAGCAAG GCAAAACAAA ACACAAAACT 900
AAGCAAAACA AACAAGACAA ACCAAAGCAA AGCAAAACAA AAAATATACA CTCATAATAT 960
AAATAATTAA AGATATATAT TATATTCAAA TAAAAACAAT AAAACAAAAA AAGCAAAGCA 1020
AAGCAGAGCA GATTAGAGAA AAACAAAGCA AGACAAAACT TAAAACAAAA TCAAAGCAAA 1080
AAAAAAGCAA AGCAAAGCAA AGCAGAGCAA GACAAAACAC AAAACAAAAT CAAAGCAAAA 1140
AAAGCAAAGC AGAGCAGAGC AGAGCAAGAC AAAACACAAA ACACAAAACA AAATCAAATC 1200
AAAGCAAAAC AAAACAAAAC AAAAAAAGCT AAAGCTAAAG CAAAGCAAAC ACAAAAAAAC 1260
ACCTATGATA TTCGAAAAAA CTGTACTAAT AACTCTCAAC ATACCCTTTA AATTTTGAAC 1320
AAATCAATGC AACATGGTGA GCATAAGAGT CTTAAAACAC TAATACTGCA TCTCTTGCTC 1380
TGCAAAATGA ACTCCTGCTT TCAGTAGAGA GACTCTGCAG AGCTCTGTTG TGGACGGCGG 1440
TGATCAAAGT AATAATTTGT ACAATGAAGA GAAAGACTAG AGTGTAGCGC TTTGAAGGTG 1500
ACCCCTGTAT GTGGACTTTT ATCATGACTC TGCACACTTG GAGAGCTCAC CTAAAGAAGG 1560
TCCCGGCGGG GCAGCGCTGC GGGACAGTCT GACAGATGAG AGTTCAAACA GAGAGGAGAG 1620
CGAAGGAGAG AGAAGAACAA GCAGGACAGA TGAAGACCAG CGCGGGGACA TCGGCATCAC 1680
CCTGGGGGGA GAGGCTGAAA ATGGGCCGGT GCGATGGGTA GTCATCAATA ATAAGTGAAA 1740
GGCAGTTCTG ACAGCTGCAT GGAAACTGAT AAGAGAAAGA GAGAGAACCT TTGATCTCTG 1800
CGGGGAGATT CACTAAACAG CCTCTTTCAT GGGTGAAACT ACCTGCAATC CACTTGTGCA 1860
TTCACATCTG CACTGCTATA GCGTGTATGT GTGTGTCGTA TG 1902