EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05629 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:4119106-4121588 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr18:4120032-4120042ACCAATTAAC+6.02
ESX1MA0644.1chr18:4120159-4120169ACCAATTAAC+6.02
Foxd3MA0041.1chr18:4119821-4119833AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:4119834-4119846AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:4119838-4119850AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:4119842-4119854AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:4119846-4119858AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:4119554-4119566AAAAAAACAATC-6.44
GFI1MA0038.2chr18:4119184-4119196TAAATCACTGCA+6.92
Hmx2MA0897.1chr18:4120029-4120046CAAACCAATTAACCAAT+6.03
Hmx2MA0897.1chr18:4120156-4120173CCAACCAATTAACCAAT+6.54
Hmx3MA0898.1chr18:4120156-4120173CCAACCAATTAACCAAT+6.19
IRF9MA0653.1chr18:4119784-4119799AACAAAACTGAAACA+6.1
POU1F1MA0784.1chr18:4121177-4121191TTAATTTGCATTTT-6.14
POU2F1MA0785.1chr18:4120903-4120915ATTATGCAAATA+6.32
POU2F2MA0507.1chr18:4121177-4121190TTAATTTGCATTT+6.25
POU4F1MA0790.1chr18:4119191-4119205CTGCATTATTAATA+6.15
RREB1MA0073.1chr18:4119804-4119824CACCAAACCAACCAACCAAA+6.13
ZNF384MA1125.1chr18:4119520-4119532AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:4119521-4119533AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:4119522-4119534AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:4119549-4119561AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr18:4121032-4121044AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
CAGAGTAAAT CATCTTAATA TATATGTGCC GGTACACACC ATGTACATAA GTACTGGGAC 60
AATTTAGTCA CTTGAAAATA AATCACTGCA TTATTAATAT AACTAAATTG AATGGTATTG 120
TTTTAAACAA TGATAATAAA CATACAGTAT ATAGCATAAG TTAAATATTA TTTAAGTAAT 180
GTATGCTGGC AATTGTAGGA TTTCACTAAT ATTCTATGAT AAGTCTAATA TTTTATGATT 240
GCTTTTGTAA ATTGAAAATC TTTTTCATTG TATTAATTCT AAATACTATA AATTGCAACT 300
AAAAAATACC TATTTGAATG AATCAACCAA CCAAACTAAT CAAACAACCA ACCAACCAAT 360
CAAACTAAAC CAAACCAACC AACCAATTAA ATGAACCCAC CTAACCAAAC AACCAAAAAA 420
AAAAAAAACA ACCAAACCAA ACCAAAAAAA AAAAACAATC CAACCAACCA ATCCAACCAG 480
ACTAAACCAA ACCACACCAA ACCAATCAAA TGAACCAACC CACTCAACCA ACCAACCAAC 540
AAATCAGTCC AACCAAACCA AACTAAACTA AACAACATTA AACCAATTTA AGCCAAGCCA 600
AATTAAACCA ACCCAACCAA CCAATCAAAC AAACCAACCC AACCAAACAA CCAACAAACC 660
AATTGAACCA ACCAAACCAA CAAAACTGAA ACAAACCACA CCAAACCAAC CAACCAAACA 720
AACAAACCAA ACAAACAAAC AAACAAACAA ACCAACCAAA CTAAACCAAA CCAAACCAAA 780
CCAACCAACC TACTAATCAA ACAAGCCAAC CAAACTAACC AACAAACCGA TCCAACCAAC 840
CAACCAAACC AACAAATAAA ATAAACCCAA TCAAACAAGC CAAGCCAAAC TAAACCAAAC 900
CAAACCAAAC CAAACCAAAC CATCAAACCA ATTAACCAAT CAAACCAACC AAATCCACCA 960
ACCAAGTGAA GCAATCAACT AAACCAAGCA AATCAACCAA CCCAACCAAC CAATAAAATA 1020
AACCCAACCA AACAAGCCAA ACCAAGAAAT CCAACCAATT AACCAATCAA ACTAAGCAAA 1080
CCAACCAACC AAACCAAACC AATCCTACCA ACCAATCAAA AGAACCAACC CAACCAACTA 1140
ATCTAACAAA CCCAAGCATC AACTAATCAA AACAAACCAA ATCAAGCCAA ACAAAACCAA 1200
ACCAGACCAA CCAACCAACC AACAAATTAA ACCAACCAAT CAAACCAACC AAGCAACCAA 1260
ACCAACCAAC CAATCAAACT AACCAAACCA ACCAACGAGT TGAACCAACT AACCAAACCA 1320
ACCAAACCAA ACTAATCAAA CCAACCAAAA AAACATCCAA ACCAACCAAA CATTACAACC 1380
AATCAAACAA ACCCTAGCAA CCAACCAAAC CAACCAACCA ATCAAACCAA CCAACCAATC 1440
AAACTAACCA AGCCAACCAA CCATTTAAAC CAACTAAGCA AACCAAACCA ATCCAACCAA 1500
CAAACCATCC AAACCAACCA AACATTACAA CCAATCAAAC AAACCCTAGC AACCAACCAA 1560
ACCAAGTCAA ACCAAGCAAA CCAACCAAAT CAACCAACTA ACCAATATAA CCAACCAAGC 1620
CAACCAGCAA AATACATAAA TCTAGCAAAG ATCTGCCGAT GGGGTAGTCT AATAAAAAAA 1680
TAATTATTTT ACTTAACTGG TTGTGAGATC ATTTGATAAA TCCACAACTT TCCTTTTTTT 1740
TTACCTGTCT ATAAAATGCT TATTGATAAC TGTTAAGTTT ACCAAACTGT TTTTATAATT 1800
ATGCAAATAG TTCATTTACC TAATCATTTC AAGGCAATGA GCTTTTTTGC AGTGTGGTAA 1860
ACTGAATCCA AAACCCTTGG CATCCGTGAT CTCAGTGTCT GACGTCATAT CGTGCGCACC 1920
TAGCAGAAAA AAAAAAAATC TGACACATTT ACAGGTACAC ATCCACTCAT ATAAAGGCAA 1980
AAGTTTGAGG GAGTCCCTCC TGCTGCAGCA ATTTCCTTCC GAAAACCACT CTTTTCCTCA 2040
CATGAAAGAG AAAATCACAG GTTTCATTTC TTTAATTTGC ATTTTCTCAC TCCCCAAACC 2100
CTTTTTAATC ACTCCCTTGT GCGCAGGATA ATTAATGTTT CTCCAGCGAC ACCCCCTCAT 2160
CCAGTCCTCC TCTCACCTTC CCTTTTTGTA CATATTTTAT TTATTTTTTT CTGCATCACA 2220
AACGAATCCA ATGAGTTCAT CGTCCACCAC AGTCCATTAC CTGAACACGG ACCCCCGATA 2280
GCTTTACTGC TTCCAAAGTT ATCCTGTGAA AAATAATGGA CGTCCTCAGA CCTGCAGATG 2340
ATTTCCATTA CGGTAAAGGA AATTAATCAC AGCATGACAA TTGCAATATC AGACTCTCTC 2400
TGTCCTTCTG TTTATTGTGT TTGTCTGTGC ATGCAAACTT ATTGAACGTA AAAAAAAGCA 2460
TTGTCGAGTC TCCTGTGCTT TG 2482