EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05627 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:4058702-4060868 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr18:4059619-4059630TTTGATACATT-6.02
DMRT3MA0610.1chr18:4059879-4059890TTTGATACATT-6.02
DMRT3MA0610.1chr18:4059975-4059986TTTGATACATT-6.02
DMRTA2MA1478.1chr18:4059618-4059630ATTTGATACATT+6.04
DMRTA2MA1478.1chr18:4059878-4059890ATTTGATACATT+6.04
DMRTA2MA1478.1chr18:4059974-4059986ATTTGATACATT+6.04
DMRTC2MA1479.1chr18:4059618-4059630ATTTGATACATT+6.74
DMRTC2MA1479.1chr18:4059878-4059890ATTTGATACATT+6.74
DMRTC2MA1479.1chr18:4059974-4059986ATTTGATACATT+6.74
FOXC2MA0846.1chr18:4060243-4060255TTTGTTTACATA-6.74
FOXK2MA1103.1chr18:4060243-4060254TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr18:4060243-4060254TTTGTTTACAT-6.14
Enhancer Sequence
TGTGGTTGAA CTAACACTTT GTATGGCTCT CGTCAGTCTG TTGAGTTTCT CTTTCCTGCT 60
GCCCTCCGTC TGTTTTCCCT GTGAAGAGCC ATTAAAGCTG ACTTCAGGAC CCGCTGTGAT 120
TTGCTGAGGG TTTGTGTCTT TTTTTGGCAT TCAGGGTTTC CATTATCAAG CTGACTCAGG 180
CAATAAAAGG AGATGTGAAT GCAAAAGACG ACAGAGAAAT TTTGGTCACC ACTGACAAAT 240
TCTTTCAAAT GATGGAATGA AGGAAGATAA TAATAGAGGT TATAAAGCAT ATATGCATAT 300
ATTATCAAGA AAAACTGGAT GTTTCTTTCA TGAATGACAC AAATGGGATG GATGGATGGA 360
TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATAGTTGGT 420
TGTTTAGTAC ATTGGTTGGT TGGTTGGTAC TTTGCTAGAT TGGTAGATTG ATTGGTTGGT 480
TGGTAAGTTG GTTGGTCGAT TGGTTATATG GTACGTTGGT TGGTACATTG GTTGGTTGGT 540
TGGTTAGTAC ATAGATTGGT TGGTATGTTG GTTGGTTGGT ACATTGGTTG GTTGGTACAT 600
AGATTGGTTG GCATGTTGGT ACGTTGGTAT TTAGTACATT GGTTGGTTGG TACAATGATT 660
GGTTGTTATG TTGGTTGGTT GGTTGGTACG TTGGTTGGTT AGTTGGTTGT TAGGTAGGTT 720
GGTTGGTTAT TTGGTACATT GGTTGGTTGG TAGATTGATT GGTTGGTTGG TTGGTACATA 780
GATTGGTTGT TATGTTGGTT GGTTGGTACG TTGGTTGGTT GGTTGTAAGT TAGGTTGGTT 840
GGTTATTTGG TACATTGGTT GGTTGGTAGA TTGATTGGTT GGTTGGTACA TAGATTGGTT 900
GGTATGTTGG TTGGTTATTT GATACATTGG TTGGTTGGTA CATAGATTAG TTGGTTTGTA 960
CATAGATTGG TTGGTATGTT GGTTAGTTGG TTGGTTGTTT TGTAGGTTAG TTGGTTATTT 1020
GGTACATTGG TTGGTTGGTA GATTGATTGG TTGGTTGGTT GGTACGTTGG TTGGTTGGTT 1080
GGTTGTTAGT TAGGTTGGTT GGTTATTTGG TACATTGGTT GGTTGGTAGA TTGATTGGTT 1140
GGTTGGTACA TAGATTGGTT GGTATGTTGG TTGGTTATTT GATACATTGG TTGGTTGTTA 1200
CATAGATTAG TTGGTTTGTA CATAGATTGG TTGGTATGTT GGTTGGTTGG TTGGTTGGTT 1260
GGTTGGTTGG TTATTTGATA CATTGGTTAG TTGGTTGGTT CATAGATTGG CTGGTTGGTT 1320
GGTTGGTTGG TTGTTACATT GGTTGGTTGA TACATATATT GGTTGGTAAG TTGGTCGGTT 1380
GGTGTTTTGG TACATTGGTT GGTTGGTACA TTAATTGGTT GGTTGGTACA TAGATTGATT 1440
GGTATGTTGG TTGATTGGTA CATTAGTAGG TGGGTTGGCT GGTTGGTTGG TTGGTTTGTT 1500
ATTTATTTGA TGCATTGGTT GGTTGGTGCA TGATTGGTTA ATTTGTTTAC ATAGATTGCT 1560
TGGTATGTTG GTTGTATGGT TGGTTGGTTA TTTTAGTACA TTGGTTGGTT GGTACATAGA 1620
TTACATAGAT TGGTTGGTTG GTTGGTTGGC TGGCTGGTTG GTTATTTGGT ACATTGTTTG 1680
GATGATACAT TGATTGGTTG GTTGGTTGGT ACATTGATTG GTTGGTACGT TGATTTGGTT 1740
GGTTGTTTGG TTGGTACGTT GGTTGGTACA AAATATTGAT ATGCCAATAT AACATGACAT 1800
TTCATGTCAT GTTACAATAT CAATACTCTG GCATGAAGTA TCAATCTTTA TCTAAATGTA 1860
CAAAAAGCCA AAATAATCAA TCAGACTTAC ACTGACTGGA GCAGTTTACA GCTTTGGCTG 1920
CAGTACATCC AGCCGCCACC AGGTGTCCAC CAGCCGCATT CAGTAACGGT GGATAAACCA 1980
CACATTAGAG ACGAACCTTT AAACCACTGA CAAATGAGTC ATTGCAGTGT TGAAAATCAC 2040
AGGCATATGG ATACCTTTTA CTGTTCAAGC TCGATCAAAG TATTTGTGTT TCAGACATCT 2100
AACTCTCCCA AATCTTCTCC TAAAATCTTC TACTAGTTTC TCCCTCAAAG ATCTGCTTTT 2160
ATTTCG 2166