EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05619 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:3366939-3369317 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:3368488-3368500AAACAAACAAAC-6.32
KLF9MA1107.1chr18:3368712-3368725ACCCACACCCACA+6.32
PBX3MA1114.1chr18:3367245-3367262AGATGAGTGACAGCAGC+6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr18:3368812-3368829GGGTCTTGAAAAGGTCA+6.18
RREB1MA0073.1chr18:3367875-3367895ACACAACACACACACACACA+6.19
RREB1MA0073.1chr18:3368624-3368644ACACAACACACACACACACA+6.19
RREB1MA0073.1chr18:3368707-3368727CACCCACCCACACCCACACA+6.27
RREB1MA0073.1chr18:3368703-3368723CACCCACCCACCCACACCCA+7.44
ZNF263MA0528.1chr18:3367051-3367072CCCCCTCTCTCTCTCTCCTCA-6.26
ZSCAN4MA1155.1chr18:3367566-3367581CACACACACTGAAAA+7.24
Enhancer Sequence
GGTTTGTGGA AAAGGAGAAA AAGCTTTCAG TAATGAGATT TAAAGCTGAA TAAACAGAGA 60
CGGGAGCAGA CGGTGTCACT CACCACAGTG CAGGAATGAC TCTCTCTCTC TTCCCCCTCT 120
CTCTCTCTCC TCAGGTGTGC AGAAGAATCC ACACAGGTGT GTCCTGATGA AGATGAATGT 180
GCAGAGGAAC TGCGTGACTG TATGTGTGTG TGTGTGTGTG TTGTCTTCTG CTGTGTGAGA 240
CGGTTATCAA CTCTCTCCTC ATTCACCAGC ACTGATCCTC ACAGGAGGCA GGGGGAGGAG 300
CCAAGCAGAT GAGTGACAGC AGCTCAGCGG GAGACGCGCA CACACACAAA CAACTCGTAT 360
AACAAACACA TCACACACAC ATAACGGAGA CAAACAACAC ACTCTTTAAT GTACACACAC 420
ACGCGCGCAC ACTCTCAAAC ACATCACACA AACATAACAC AGACAAACAA CACACTCTTT 480
AATGCACTAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAAACAC ACAACACTCG AACACATCAC 540
ACACTTACTC ACAAACACAT GTACATTATA ACACTCAACA CACTGTCAAA CACAGGCACA 600
CACTCACTTA GAAACACACA TATAACACAC ACACACTGAA AAACACAAAC ACACACACAC 660
ACAGTCTCAA ACATATCACA CACAACATAC TTTCTCAAAC ACATTACACA CACATTTTCA 720
ATCTCACACA CATACAAACC AAAAGATCTT ACACCCAACA AAACACCCAG AAAACACCCA 780
ACAAACCCAC TACACATCTC TAACACACAC ACACATACTA TATGCACTCA CAAACACTCA 840
CTCACACAAA ACACTCTCAT ACATGCATAC AACACACACA CACACACACA CACACACACC 900
TGATTTATAA ATTGTACACA CACACTATAT ATATACACAC AACACACACA CACACACACA 960
CACACACAAA TATAAACACA GAAACACACT ACGCGCACTC ACAAACACAC ACTCAGACAC 1020
ACCACACACA TAAAACACTC TCATACTTAC AACACACACA CACTCACTCA CTCTGCACAC 1080
AAACAAAACA CACATATAAA TTGTACACAC ACACTATATA TGTGTATGCA CAACACACAT 1140
ACATACACAC ACAAACACAC ACAAATATAA ACACACAAAC ACACTACGCG CACTCACAAA 1200
CAGCCACATC ACACACATAA AACACTCTCA TACTTACAAC ACACACACAC CTACACACTC 1260
ACTGACTCTG CACACAAACA AAACACACAT ATAAATTGCA CACACACACT ATATACATAC 1320
TACATACAAC ACACACACAA ATATAAACAC ACTACGCGTA CTCACAAACA CCCACTCAGA 1380
CACACCACAC ATAAAACACT CTCATACTTA CAACACAAAC ACACCTACAC ACACTCACTC 1440
TGCACACAAA CAAAACACGC ATATAAATTG TACACACACA CACACACACA CAACACAACA 1500
CACGTAAAAC AACGACAAAC ATACATATAG TACATACAAC ACACAAACAA AACAAACAAA 1560
CACACACACA CCACACGCAT ATATACACTC TTAAACATAC ACTCACACAC ACACACCACA 1620
CACATAAAAC ACTCATACAT ACAACACACA CCCACGCACA TACCACATAC AGAACACAAA 1680
GTCTCACACA ACACACACAC ACACACACAC ACACAAATAT ATAACAAACA CAAACAGACA 1740
CACACATATA TATTCTGAAA TACGCACCCA CCCACCCACA CCCACACACA CACACACACG 1800
CATGTTTGAC AGATAACATT GAGTGGACTG AAGGGAAAGA GCGCTGAATG CAGATGAGCA 1860
GGCAGTATTT CATGGGTCTT GAAAAGGTCA CTGTTTACGG CCCGTTTGAC TCCACAGATG 1920
AGTTTTACTG CAGTGAAACC TGCAGACGAC AAGCTGATTT CTGCACAATC ACAACATCAG 1980
TCTGCTGCTG TACGCTTACA CACACTTTTT ATGCAGGTCT GCTATGTTCA TTTCTACATA 2040
GAAACAGTAC GGGACAAAAT ATTTGACCGT GTGCGAGAGA GAGTGTTTTA TGTGTTGTGT 2100
GTAAGTTTGT GAGTGTGTTA TGTGTGGGAG CATTATATGA TTGTAGTTTG TGTGTTTGTG 2160
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTAT ATGTGTGTGA GAGACTGTGT TGGACATATT 2220
AAGCTATGTT AACCATCTGC TAAAGCATAC TAGCAACATA TGTAAGCTAT TTAAGGGCTT 2280
AAAACATGTT ATCAACATAT CAAAACAAGC TAAAACATGG TTATTCAAGT GCTAAAACAT 2340
GTGATCAATA TATTAAAATA CCAAAAAATG GGCTCAAC 2378