EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05618 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:3343359-3344424 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr18:3343807-3343819AAACAAACAAAC+6.32
Foxd3MA0041.1chr18:3343811-3343823AAACAAACAAAC+6.32
NFYAMA0060.3chr18:3344353-3344364TCTGATTGGCT+6.32
NFYBMA0502.1chr18:3344354-3344369CTGATTGGCTGATGG+6.44
POU2F1MA0785.1chr18:3344333-3344345AATATGCAAATG-6.74
POU2F2MA0507.1chr18:3344334-3344347ATATGCAAATGTC+6.19
POU3F3MA0788.1chr18:3344333-3344346AATATGCAAATGT-6.03
POU4F1MA0790.1chr18:3344273-3344287CATTAATAATTCAA+6.82
POU4F2MA0683.1chr18:3344271-3344287CACATTAATAATTCAA+6.23
POU4F3MA0791.1chr18:3344271-3344287CACATTAATAATTCAA+6.99
POU5F1MA1115.1chr18:3344334-3344345ATATGCAAATG-6.32
Enhancer Sequence
CTTACAGGTC TTTATACACA TTTACCATTT ATCCAGTATT TTTAATGGTT TATAATTGAA 60
CTCCTAAATA AATTAATAAT TATTTCTGTA TGTTTCTATA AAGAAACAAA AAAGTAGTGA 120
GTAAGACTTA TATTGCTCAA ATAAATAAAT AAATAAATTT CATGACTGTG CCGCAGACAT 180
GCACGAATGC ACAAATACAC AGACGTACAC ACACAGTTTT GCATTGAAGC TGAGGGGACT 240
CCATGACGCA TCTGTCTCCA TCATCCACCA GCTGTCTGTC CTGCTCCTCC CTCCCTCACA 300
ACCTGCTGAA TAATGCAAGC CTACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 420
ACACAAACAA ACACACACAA ACACACACAA ACAAACAAAC AAACACACAC ACACACACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACTGATGTCC GAAGGGGTGT 540
GATTTGACAT ATCTGCTTCT TTCGGCCCAA CCCATTCTTC AAGGCTGATT AGCTTCCAAT 600
TAAACATACA ATACATTTCT TTAGAGAATA TATCTTGAAT TTCTGCCTTT GCTGCAGCAA 660
AAAACATACT TTGCACATTA AGTAAATGAT TCGAATATTA ATCCATGCGC TAATTTTGCT 720
TTTATAAAAT CAGAATTGAT TAACCATATC TTTATTGTAT TATATTTATA AATAAATAAA 780
ATCATCACTC AAATACCACA CTTACATTGC CTAAAAGATC ATTTTAAAAT ATTTTTTAAT 840
TTATTTATCT ATTTTATTAT TAAATAAAAA AATTATTTAC AACTACTACT ACTACTATTT 900
TAGGATATAA TCCACATTAA TAATTCAATT CCTATTTATT TCAAAGCCAA AGCCCAACTG 960
CTTCTGTACA CCTCAATATG CAAATGTCCT CCATTCTGAT TGGCTGATGG GTATACAAGG 1020
AATCACAGAT GCACCTGAGA CTCCTGTTTC CTGCTCAAGC GTCTG 1065