EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05615 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:2836124-2837086 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr18:2836831-2836848TGTATTAATTAATTAAA-6.04
DBPMA0639.1chr18:2836736-2836748TATTACGTAATT-6.04
Lhx3MA0135.1chr18:2836833-2836846TATTAATTAATTA-6.25
NFICMA0161.2chr18:2836972-2836983TCTGCCAAGTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr18:2836810-2836820ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2836834-2836844ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2836810-2836820ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2836834-2836844ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr18:2836749-2836761AATAAAAAAAAA+6.62
ZSCAN4MA1155.1chr18:2836577-2836592TGCACACACTGAAAC+8.03
Enhancer Sequence
GAAGCATTTT GCAGACTGAT ACACACACAC ACACACACAC ACATACTGTA ATCTCAAACT 60
GGAGCTAGTA TTACCCGCAC AGACTGTTCA TTGACAGGAG GTCAGTGTGT ATATAAAGAC 120
CTGATTTAGT TGCTGTCCTC CAGAACTCAT CTTCTGCTTC TGCCCAACAC ACACACACAC 180
ACACACTCTG TCAGCCTCTG CTTCCTCTGC TGGAATCAGC GCTCATTACC ATTATCACAA 240
TCATCATTAC CAGAGTCATT AGAGCTATTA TGATGGATGA GGGCTCATCT GAGGGGCTGC 300
TGAAGACATG AGACCCCGCG AGTCCAGCCA GAGGACACAC ACACAAGCAC GCATACACAC 360
ACACACACAC ACATACACAT ACACAAACAC ACACTTAAGC AGACATGCAC ACACACTCAG 420
ACACACACAT ACACACAAGA TTTGATACAA GAATGCACAC ACTGAAACAC ACACACACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTC ACACTCACAC 540
AAGCATGGAC ACGGGCACAC ACATACAAAC ACACGCAAGC ACACATACAC ACTGTGTCTA 600
ATGGGAATTG TCTATTACGT AATTAAATAA AAAAAAATAA TAATAATGAC AACAATTATT 660
ATTCTAATAA TACTACTAAT AATACTATTA ATTAATAAAA TAATACATGT ATTAATTAAT 720
TAAAAATATA AAAAATAAAT AAAAAACTAA ATAATAAATA ATTTATCAGA ACACCAATCC 780
TTCAAGAGCC TAACAATCCA AAATATGCTG TATTTCTTAA TGTCCTAATA TACATTCGAT 840
CTTAAAACTC TGCCAAGTAA ACTAGACCAA AATCACTGCT CTTCATCTCA GTCTGACCTT 900
TTCAGACTCC CCTGAAGTGA AAAATACTGT AATCTGCTGT ACAGAAAGCC ATCAGATAAG 960
CA 962