EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05600 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:2262490-2263770 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr18:2262682-2262694TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr18:2262857-2262869TTTGTTTATTTA-6.18
FOXC2MA0846.1chr18:2263164-2263176TTTGTTTATTTA-6.18
Foxj3MA0851.1chr18:2263102-2263119TTATTTGTTTATTTTTC-6.17
Foxj3MA0851.1chr18:2262982-2262999CTGTTTGTTTATTTTTT-6.65
Lhx3MA0135.1chr18:2263268-2263281GATTAATTAATTT-7.82
POU6F1MA0628.1chr18:2263269-2263279ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2263269-2263279ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr18:2262713-2262726TATTCATTCATTT+6.42
ZNF384MA1125.1chr18:2263457-2263469TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:2263458-2263470TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:2263459-2263471TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:2263460-2263472TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:2263461-2263473TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr18:2263462-2263474TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
ATATCATAAA TACACAATTG TTTTGCTTTT TTAAATTTTC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC 60
TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC 120
TTTCTTTCTT TCTTTCTTTT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTTTTTCA TTTTTATCTG 180
TCTGTCTGTC TGTTTGTTTA TTTATCTATC TGTATGCATT TTTTATTCAT TCATTTTTCT 240
GTGTCTGTAT TTGTATTTTA TTTATTCATC TGTTTGTTTG CTTGTTTTTT TTTGTAAATT 300
TTCTATAATT ATGTGTCTGC CTGTCTGATT TTTTATTTTT TATTCTTTTT GTTTGATTAT 360
TTGTCTGTTT GTTTATTTAT TTATTTGTCT GTTTGTCTGT ATTTTATTTA TTTATTCATT 420
TATTTGACTT AATTATTTAT TTATTTATTG CTCTGTTTGT CTTTAATTTA ATATTTATTT 480
ATTTATTTAT CTCTGTTTGT TTATTTTTTG TCTGTATGTC TGTCTGTTTG TTTATGTATT 540
TGTATATCAA TTTATTTTAT TTTTATGCTT ATTTATTCAT TTGTCTGTGT GTCTGTATTT 600
GTATTTATAC CTTTATTTGT TTATTTTTCT GTCTGTATGT TATTTATTTA TTTTTCTGTC 660
TGTCTGTCTA TCTGTTTGTT TATTTATTTA TCTGTCTGTC TGTCTGTTTG TTTGTTAATG 720
TATGTGTCTG CCTGTCTGTT TTTATTTATT CATTTATTTG TCTGTTTATT TATTAATTGA 780
TTAATTAATT TATTTGTCTT TTATTTATAT ATCTGTTTAT TTTATTTATT TATGTATTTA 840
TTTATTTATT TACCTGTTCA TTAATTTATC TATTAGTTTT TTTTAATTAT TTATTTACCT 900
ATTTACTTTT GAAATTACTA TAGTGTCCAC AATTCACTCA ATTCCTGAAA TACCCCATAA 960
CTAGGTGTTT TTTTTTTTTT TTTTCAGTAC ATATACATCA GTTTTTACAG AATTCCTATA 1020
CATCCTCACC TTTACCACAT CCTTGTTTCC TTCCTCCTCT GATCCCTTGG TCTTCCTGTT 1080
TGTCCTTCTG AGAGCAATAG AGAACGTGTT GATGATTTTA CGGGGTCACC ACACACTGCG 1140
TCAACACCAC CATGGCCTAA TTACTCAGCT GTGGCCCAAA GACAGGGAAC GTTGTGATGT 1200
GCAAGCCAAA CAGAGGAGCT GTAATCTAGG CCAGCTCACT TTCTCTGTGT TTGGAGAACA 1260
GTTTCGAATC ACATGTGAAG 1280