EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05581 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr18:740571-741692 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr18:740903-740914AACCACTCAAG+6.32
POU4F1MA0790.1chr18:741306-741320AATTAATAATGCAG-6.35
POU4F2MA0683.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.67
POU4F3MA0791.1chr18:741304-741320TTAATTAATAATGCAG-6.75
PRDM1MA0508.2chr18:741338-741348TCACTTTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr18:740974-740994CCCCAACACACACACACACA+7.29
Enhancer Sequence
CTGCCAGATG CATTAGTGTA AATGTAAATT AGAGGTTTTG ATTAGTAAAG CAAATGCAAA 60
TGTGTGTTTA TTTGAGCAGC GAGTATCACA GTGTGCGTGT GTGTCTGGAA AAACCCCGTC 120
TGTAATCCAG TGCAAATAGT TGCCTTCAGT CCCACCTGCG GACCCACCCG GAGTCACCAG 180
ACAGAGCGGA AAACACATGG GATTATCCAG TAACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 240
ACACACACAC ACACACACAC ACACGTACTG ACTATGGCAC TACTGAATGT GTGTGACCTG 300
AGGAAGTGTT CAGAAACATC TAAACACCCA CCAACCACTC AAGTTGATCC AGAAGCAGTT 360
CAGTAGATTC CCTTAAACAG CAGAGAGCAT TCCACTGACC CTCCCCCAAC ACACACACAC 420
ACACACAGTC TTACAGACAT GCAGACACAC AGAGATAGAC ATGCATGCAC ACAGACGCTC 480
ATAGACACAT AGACATACCC ATACATTCAC AGATGCACAC ACACACACAC TCAAAGACAC 540
GCATATACAC ACATTTGTCA CAGAGACATG TACTTGCTCA CACACAGACG CATTGCAAAC 600
TCACACACAG ACAAGTAAGC ATGTATTGCA CACATACACA TGCACACATA GGCAAGCACA 660
CACACACACA CACACACACA CACACGTCTC ATCCTTAATC CTCATGCTAC AGAATTTCAT 720
TAGTTTTGAG CATTTAATTA ATAATGCAGC ATTATTAATA ACCCTCATCA CTTTCACTTG 780
CAACACCACG GTCAAGGGTT CGATTTCCAA GGAATGCATG AAAGTGTGAT GAGATAAGAT 840
CCTCCACACA CACACGCACA AATGCACATG TCATATTCAT GTCATATTGT TCAGCCTTTT 900
CACTTGTACT CGTGCAAAAC GCAAACAAGA TGTGGTTTAG TGAGGGACGC AACAGCAGGA 960
ACGCTCCGGA TCATTTGAAG AGTCTCTCAG TCAAACTGCA GTAAACACTG CAACACAGAA 1020
CTGATATATT TACTCACAGT TTGAGTCTCG TTTCTAGTCC AAATGTCTAA AAACTCCTAA 1080
ATCAAGAAGC AAATGTAGGT AAATGTAGTC TGGTTTCGGG G 1121