EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05399 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:39269893-39272311 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr17:39272204-39272219AATTAATGATTAAAA+6.71
NEUROD1MA1109.1chr17:39270193-39270206GGACAGATGGTAA+6.02
NFAT5MA0606.1chr17:39269982-39269992AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr17:39269982-39269992AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr17:39269982-39269992AATGGAAAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATTGAGTTA CAGCTTCTTC TGTCAGTTGC TTCAGGTAGA TGAATGAACA GACAGATAGA 60
TGGATGTATG GACAGATGAA TAAAGTGATA ATGGAAAATG GATGGATGGA TGAACCAGCA 120
GATAAATATT AAAAAAAGCA CTGAAATCAA GGCTAAGTGC AAAGCTTAAA CTCATCATTC 180
TCCATTTGCA AATTTAACCT GTTTGTTTAA ATTTTAAATC AAATATAGTG GAAAATTAAA 240
CATTAATAGA TTTAAGTGAA ATGTTGAAAA GATGAATGGA TGATGAACCA ATAGATGGAT 300
GGACAGATGG TAACAGATGG ACAGATGGAG GATGGACAGA TAAATGGATG GATGAATGGA 360
TCAACAGACA GACATACAGA TAGACAGACG GAAAGAGATT GGCTGACACA TGATAGATAA 420
ATAGATAGAC AGAGAGATGA TATATAGACA GATAGACAGT CCGACGATAC ATAGAAAGAT 480
AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAATATA TAGACAGATA AACAGACAGA AGATATATTG 540
CCAAAGACAG ACAGACGATA TATAGACAAA CAGACGATAT ATAGACAGAT ATACAGACAG 600
ACAAAATACA GTCAGATAGA CAGACAGATG ATATATAGAC AGATCAACGA TAAATAGTCA 660
GATAGACAGA CAGGACAGAC AGACAATATA TTATCAGATA GACAGACAGG ATAGACAGAC 720
AATATATAGT CCGATAGACA GATAGAAAGA CTGACAATAT ATAGACAGAT AGAAAGACAG 780
ATAATATATA GTCAGAAAAA AATACAGACA AACAATATAT AGAGAGATAG ACAGACAGAC 840
AGATGATACA TAGTCAGATA GAAAGACAGG ACAGAACGAC GATAGACAGA TAGACAGACA 900
GACGATATAT AGTCAGATAG ACAGACAGGA CAGACTGACA ATATATAAAC ATAGACAGAC 960
AGATGATATA TAGATGGGCA TATATATATA TATATATATA TATGTCAAAT AGATAGACAG 1020
ACAGACAGAC AATGTATTGT CAGAAAGAGA CTGTAGTATG GAAAAGTAAA AACATAGACA 1080
AACAGAAAGA CCAACAGACA ATATAGAATG ACAAACAGAC GGACAATATA TAGTCAGGTA 1140
GACAGACAGA GAGACAATAT ATAGTTAGAC AGATCAACAG ACAGACAGAC AGACAGAAAG 1200
AGACTGATGA ATGTACGAAT GGTAGAAAAA CAGACAGATG ACAGACAGGC AACATAAATA 1260
AAGACAGACA GATGATACGT ATATAGATAG ACAGACAGAA AATTTATTGA CAGAAAGATA 1320
CTGACGGGTG GAAAAAAAGA AAGACAGACA TACAGACAAT ATATAGAACG ACAGACAGAT 1380
GGACAATATA TAGTCAGGTA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA 1440
GAAAAAGACT GACAGATGAA TGTATGATAG AAAGATAGAA AGACAGACAA ACAGATATAT 1500
AGAAAGATGA TAGACAGACA ATATATAGAA AGTCAGACAG ACAATATATA GTCAGATAAA 1560
CAGACAATAT ATTGTCAGAC GGACAGACAG AAAGCAACTG ATGGTAGGAC AATGGAAAAA 1620
TAGACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA GCCTGACTGA TGCATAATAG 1680
AAAAATAGAC AGACATACAG ATGATATATA AAGACATATA GACAGACAGA CAGACAGACA 1740
ATATTTAGAA ATACAGACAG ACAAACAGAA AGAAAAACAA TATACAAAAA TAAAAACAGA 1800
CAGACAGAAA GACGATATAT AGAGACACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 1860
AGACAGACAG ACAAAACGGA CAATAGAAAA ATAGAGAGAC AGACAGACAA TGTATAGAAA 1920
TACAGACAAA CAGACATAGA GGCAATGTAT AGAAATACAG ACAAACACAG AGACAGACAG 1980
GCAATATATA GAAATACAGA CAAACCAACA GACAGACATA TGGAAATATA GACAGACAGA 2040
TAAACAGATA GAGCGACGGA CGATAGACAG TGACGGACAG ATGTAAGGAT GGACAGATTG 2100
CTATATTTAT AGACAGACTT TGTTTTGACT CAGACAAAAT GGGTTGATGT CTCTGCTGCT 2160
CCTTTTGTTC TCTGTGTAGA GTTTGCTAAA GCTTGAGGAC GTCACTGATG CTCCCTGAAG 2220
AGCAGGTCAC CTGACCTTCA TGTGTGCGCA GCAGGGCTGC TAAGACTCCA GCACAGCCTG 2280
GAAATGCTCC CCTGACACAC ACATACACAC TAATTAATGA TTAAAAGCAA GAAATAAGCA 2340
ACCCTGCACG CTGTGTCCAT TTGTGCTATA ATCATAGTCC CTTTATATAC ACTAACTACC 2400
TTCTTAGTGC AAATCATC 2418