EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05287 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:29874269-29875489 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr17:29874668-29874685TGACCCCTCCATAACCT-6
RREB1MA0073.1chr17:29874370-29874390CCCCCCAGCACCCCCTCTCC+6
Enhancer Sequence
TGGTTTGACC CAGACTAACC TGTCCCAAAT CCAATCCTTG TAATACATTT CAGGGCAACC 60
GTCAAAGCAC GGTCACCTTC CTTTTAAAAG TAATGCATCA ACCCCCCAGC ACCCCCTCTC 120
CAAAAAAAAT AAAATACTAC ACACCAACGT AAGCACAATA ACATAAGTGT TATTACAAAC 180
ATATCTCTCA ATAAGGATAC TGTTGGAACT TTTTCAGTGC ACCTTTATAC ACACTCGAGA 240
TTCATCACTT GTTCATAGTG ATACATAACT ATCACTCAAT ACCTTGCAAA TGAAAATTAA 300
TGAACAAATA CAAATGTTAC TTAAAATGAA TGAACACTTC TAAGAAAAAA AAATGAAATG 360
CTTAAAATAA ATCAAAAAAA GTGGAGGCCC TTTTCTCCCT GACCCCTCCA TAACCTCTAA 420
AGTAATAACC ATAAATGACC TGAAATTACA ACAGTCAAAC AAAGACATTT TACAGAAGAT 480
GGCCTGAGAG GGAACGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAAAGAG 540
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAA AGAGAGAGTA GAAGGGCCTG GTGAGGACTC 600
TTAACTGGTC ACATCTGGCT GTATTTTATA CGCAAATCAG CCCCCACTAA ATCTAGATAA 660
AACTCACTGA CTCGTGATCG GAGCAATGAT CTTCATACAT CTAAATTTAT ATGCTAATCG 720
GAATCCTTGA AGCATTTAAC ACATTCCTCT GCATCTGGAG GGGGCGACAA GCAGCAACCT 780
CTCCAACCTA TACCCATAAA CTCAACATAA ACTTTCTCTA GCCTTCTAAA CCCACATCTA 840
CATTTCAGCT CATCTTATCT ATCTATGTCT GTCTGTCTGT TTGTCTCTAT CTATCTATCT 900
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 960
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTAGAT 1020
AGATCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTATTT GTCCTTCTGT CAATCTGTCT GTCTGTCTGT 1080
CTGTCTGTCT GTCTGCCTGT CTGTCTATCT ATCTATCTCC AGAGTAAAAG AAAAAGCAGA 1140
TGTACAGATG GCTCTTCATC AACACACACA CTCACAGAGG AAAACCACAA AACACAAATG 1200
AACATGATCT TGTCAGTATG 1220