EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05251 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:27743246-27744304 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr17:27743263-27743275TAAATAAACAAA+6.18
LHX2MA0700.1chr17:27743393-27743403GTTAATTAGT-6.02
TFAP4MA0691.1chr17:27744173-27744183ATCAGCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
GTGCTGTTAT ATAAAAATAA ATAAACAAAA TAACCTTTTT TAAAACAAGA GTCAGATCCC 60
TATTCCTAAC TTGTCTCGCA TCCACAGCTG CTCATGGAGA TGAAACTGTT TCTCAGCTCT 120
GCCACTCCAC ACGCTTGCTT AACACAGGTT AATTAGTAAT TAGCTAGGGC ATCCAATAGG 180
TTATCTCTTC TTTCCTCTCT CACTCTCTCA CACTCAGTGT CTGTATCTCG CTTTCTCTTT 240
AGATGTATGG CGTATAGATT AATTGAATGA TATGCTGAAA CTTTAGAGAT TTCATTTCTT 300
ATGATGAAAT AATGCAGAAA GCAAGCAGAC GTTGCGGAGA CAGCAGTGGA ATGATCATGG 360
ATTGTAATGT TTTCCTCTTT CCCTCTGGAG GATTGAACTA AATGTGATGC AGGGAGCAAG 420
ACAAAATGCA AATATATGGG GCAGAGAGAT AGAGCGAGGA GGTGTACAGG GATGACTAAG 480
GTAAGAAATG AATTGCTGAA TAGAGAGGAT GTGTAAAGCT GCAGAGAAAG AGCGAGGTGA 540
GGCAAAGGTG ATGCTGTGTG CTGACACCTG TTTACAGAAC TGACAGAAAA ACAGACGAGC 600
GGGCAGAATA CTAAAGCGAT GTGGCGAGAA AGGAGTCTGT TTTCTGATGC TTTCCTTCAC 660
AACTCCTGTG ACAGATGTGC TTACACTGTG GCGAGTAGAT TGTTGTTTCA GTTTGTGTGT 720
GTGAGAGAGG GAGAGTTGAG TGCATCTTGT ATCACTCCAC CGGGAGGCCC CAGTTGGATG 780
CATTACCTCA GATTTTTTTT TTCTTCTCCC CAACTTGCTG GATTAGCTGT TGTCAGCGCT 840
CGTTTCCCCC TCCACATTTC CTTGTGCTGT CCACAACTGA TCAGAACCTC CACCAGTGCA 900
ACATTTGCAG AATTTTCATG ACTTGCCATC AGCTGTTAAA TTGATGAAAA CAAATTGAGC 960
TAATTTTCTA GCTTCTACAA AGCTAACTTG CTCAAGTGTG CAGTTTTGTC CCTTTTGTAA 1020
TATTTTCCAG TTAGTAATTC GGAATGCACA AAGTTAGA 1058