EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-05100 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:16692543-16694769 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr17:16693422-16693433ATATTAATTAT+6.02
GFI1MA0038.2chr17:16693142-16693154TGCTGTGATTTG-6.52
Gfi1bMA0483.1chr17:16693142-16693153TGCTGTGATTT-6.62
RFX1MA0509.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC+6.62
RFX1MA0509.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC-6.63
RFX2MA0600.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC+7.04
RFX2MA0600.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC-7.05
RFX3MA0798.1chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC-6.64
RFX3MA0798.1chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC+6.99
RFX4MA0799.1chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC-6.37
RFX4MA0799.1chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC+7.04
RFX5MA0510.2chr17:16694400-16694416GTTTGCTATGGTAACC-6.05
RFX5MA0510.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC-7.29
RFX5MA0510.2chr17:16694251-16694267AGTTGCTATGGTAACC+7.4
Sox6MA0515.1chr17:16694097-16694107CCATTGTTTT+6.02
mix-aMA0621.1chr17:16693126-16693137CCTAATTAATT-6.32
Enhancer Sequence
AAGCACATGA ATGCAAATAT ACTGTACAGT GGGTTACAAA TGTCTGAGTC TGCATTAAAC 60
ATCTGAATCT GATTTTAAGC TGTTTAAATA TAGTATATAC AGTAAAGGAT ATAAGAATTT 120
GTGCAGAAGA AAGTATATAT ATATATATAA TAGGAATTAC TGTGAAGGGT GACACGGTGG 180
CTCATATTAT TATTAATAGT ACTAGAATTA ATAGTAGTAA TAGTAGTAGT AGTAGTAGTA 240
GTAGTAGTAG TGATAGTAGT AGTAGTAGTA GTAGTAATAG TAATGATAGT AGTAGTAGTA 300
GTAATAATGG TAATAGTAAT AGAAGTAGTA GTAATAGTAG TAATACTAGT AGTAGTAGTT 360
GTAGTCGCAG TAATAATAAT GATAGTAGTA ATAGTAGTAG TAGTCGTTGT TGTTGTTGTA 420
GTAATGATAG TAGTAATAGT AGTATTAATA GTCAGAGGTG GACTGGCCAT CTGGCAGACC 480
GGGTAATTTC CCACTAGGCC GGCATACTTT TTGGGCCGGG CTGATCCTCT TCTTATGATC 540
TGATCGACAC ATAAAATACT TAGCAGATTG TCGTGTTTTT CTGCCTAATT AATTGACAAT 600
GCTGTGATTT GTGACGCTCT GAAAGTAAGA TGTTTCTTTT TCAAACAGAC CATCCAATGC 660
GACATAGTAA GCAGCCCATT AGTTCTTTTC TTTATTGACA TTGACATTGT AGTAGTAGTA 720
GTAGTAGTAG TAGTAGTAGT AGTAGTAGTA AGGTTAGTAG TAGAAGTAGT AGTAGTAATA 780
ATGATAGTAG TAGTAGTAAT AATAATAATA GTAGTAGTAG TAGTAGTAAT GATAGTAGAA 840
GTAGTAGTAG TACTAGTAGT AATTTTAGTA GTAGTAGTAA TATTAATTAT AAAAATAATA 900
ATAGTGGTAG TAGTAGTAGT AATAGTACTA ATTTTAATGA TAGTAGTAAT AGTACTAGTA 960
GTAGTACTAG TAATAGTAGT AGTAGTAGTA TTAGTAAAAT TGATAGTAGT TGTAGTAGTC 1020
ATAAGAGTAG TGGTAGTAAT GTTAGTAATA GTAGTAATAA TGATAGTAGT AGTAGTAATG 1080
ATTATAGTGA TAGTATTAGT AGTAATTGTA GCAGTAGTAA TAATAATAGT AATAGTAGTA 1140
ATATTAATTT CATAATTATT AAGCTTTACT TATTATTATT GTTATTATAT TTTTTATTAT 1200
TTAATATTTG TGAGGTCTGT CTATCTTTCC CTCCTCACAC CCCACAGTTC CTCCATCTCC 1260
TTTTCCCACT CCCACTGAGG AAGGCAGGCA TTGTGTCTGT ATGACTCACA TGAAAGAAGA 1320
ATAAATCTAC ATTTTTTGTC AGGCTAGTGA AGACAGTAAA ATGAAGTGAC AGAGAAAAAG 1380
AAAGTGGGTG GAGTGAGCTG GGGAAGGGAA ATATTTAAAG ATGCCCCTAC TGCTTTTAAT 1440
GCAGAATCAC ATAATCTAAC AGGATTGTTA TCATAACAAA AACAGTGTGT GTCTGAACAT 1500
AGTATTAAGT GCTTGCTAAG AAGTTTCAAG CTGGATGGTA TTTCATAAGT TCTCCCATTG 1560
TTTTTAGTGT GTTGCTACAG TATGGTGGAA ATAGTTGCTG TTGCTAATAT GTTGCTTTTT 1620
TAACCTGAGT GGTAGTTATG ATGTTTTGAG AGTTTCTAGT TGCTAGAGCA TTGATAGGTA 1680
CTGTATTTGC TATGGGGTGG TTTTTGGTAG TTGCTATGGT AACCTGGGTG GTTGAAAAGT 1740
GTTGTTCTCT GTTTTTGACA GTAATCTGTG GATATTATGG TGTTTTGGGG CGGTTGCTTG 1800
AGCATTGTTA TGTGTTTTGC TATGGAAACC TGGGGGTTTG GTAGAGTTTT TCTAGGTGTT 1860
TGCTATGGTA ACCTGGGTGT TTGCTGTGGT CGTTTTTTTT TTTGGTGGTT GATTGATTGT 1920
TGCTAGGTGC TCAATATGGT AACTTTGGTG GTTATTATGG TGTATCTAGG TATTTGCTTC 1980
GATAACCTGG GTGGCTTCTA TGATAACCTG GATGGTTATT ATGGCTCGTT TCCACTGTGT 2040
GGTACAGTAA TGAACAGTAC AGTTCAGTAC GCTTTTATGG CCGTTTTCTC TGTCAAAAGG 2100
TACTTAAAAG CCAACCGTAC CATACCACTT TTTGAGTACC CTTTCGAAAG GGAACATAGC 2160
ACAACAAAAG GGTAACAAAA GGCGGAACCC GATGTGCAGC TGAACGCTAT TGGTTTACAG 2220
AGAAAT 2226