EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04965 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:5600188-5601480 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:5600494-5600512CCTGCCTGCCTGCCTGCC-6.1
Foxj3MA0851.1chr17:5601337-5601354TTATTTGTTTATTTTTA-6.35
PHOX2AMA0713.1chr17:5600293-5600304TAATTTAATTA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr17:5600235-5600246TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr17:5600235-5600246TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr17:5600293-5600304TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr17:5600293-5600304TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr17:5600235-5600246TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr17:5600293-5600304TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr17:5600235-5600246TAATTAAATTA-6.62
SOX10MA0442.2chr17:5601185-5601196GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
GTCTTCAGTA TGAGTGTGAT AATTGTGTAG TGTGTAATTA GTTAATGTAA TTAAATTACA 60
TATGCATTGT AAAAGTAATG TAAGTGCTTA CTGTTCATTT TTAGGTAATT TAATTAGTGA 120
TTCGTGATGT ACTTACCTTA AATACTGTAC ATAAATTCAA CATCTATCTA TCTATCTATC 180
TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC 240
TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC 300
TGTCTGCCTG CCTGCCTGCC TGCCTGTCTA TCCGTCTATC CATCCATCCA TCCATCTGTG 360
GCAGGAGAGG TAATTAGTTG CCAAGTGTCA TTAATTTACG GGTCCTTTTC TCTGCCCTAT 420
CACAATACGG CATACGGGCT ATAAAAAGGA AGCATTTGCT ACCTGGGATG CGTCACTTGA 480
TTAGTTGCGG CGCCGTGAGC GCGCGTCGTC ACTTCCCACA CCTGTTGAGG GCGGTGAGGG 540
GTTCTGATCG GGCTGGAAGT TGCTTCGCCT GAATTGTTTG GCTGCAATCG CCAACGCTAG 600
AACGCGTGTA AGGACTGGAA AAGGTAAGCA AGCGTCTGTC TCATGTTTTG GTTGTCGCGA 660
TCGTTTTGGA AACGCTGTGT CCGCTTTTCT CAGCTGCGAG AACCAGATGC GGGTGCGCGA 720
CTGTTTGTTG GCTGCGCCGG CTGTTGACTG AAATGTACGT GCTATCTGCC TCTTAAGTGA 780
CTGATTGAAC CCCGATTCCC TTCGGTGAGC AGTAGGTAGG TGTTTGCATG TAGTTGCAAA 840
TGGCTTATAG CAGATTTTGG ACTTTATCAT GACTATTGAT TTATTTGTTC AGGCTGGGTG 900
GCACTCTGCG AGGGGAGCTC CGTCGGGCGC TCCGCATCCG TGTGCGGCTA CAGTGCTGTC 960
CTGTTTCCCG TGTTTTTTTT CTGTTTCCTT AGATTTTGTC TTTGTTTTCT TGTTTATCTT 1020
TTTGAGTTGT TCTGTTTTTG GTTTACACAA GGACTATTTA ACTTATTTTT TTGTTGGTAT 1080
ATTTATTTAT CTTCGTTTGT TTGGGTTTTC ATTTTCTTTA TTGGATAAAT CTATATAGTG 1140
CGGCTGGATT TATTTGTTTA TTTTTATTAT TTTGACATTC ATCCAGCATG TTTTGATTTT 1200
TCCTTACATT TTTGTGTAAA TCTTTACTGT TGTATTTTCA TTATTGCTTC ATTTATTTTC 1260
TCTTTAATTT GGTTTAAGAT TTAATTGTTT CC 1292