EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04912 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:1729489-1731727 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD13MA0909.2chr17:1729961-1729972GTTTTATTGCG-6.32
HOXD13MA0909.2chr17:1730056-1730067GTTTTATTGCG-6.32
HOXD9MA0913.2chr17:1729961-1729971GTTTTATTGC-6.02
HOXD9MA0913.2chr17:1730056-1730066GTTTTATTGC-6.02
ZSCAN4MA1155.1chr17:1731077-1731092GTTTCTGTGTGTGCA-6.06
Enhancer Sequence
TATCAGACAG CACCCGTGAG AACAGCACAG TTATACCGTT AACAGATTCA TACATGTCCA 60
GCAGTGCGTG CAGGGCCGTT GAGCGCTCCG TGTATGCTTT GGTCACTCAG TTCTGTTATA 120
AAAATCTATT TTCTTGTGAT AACGGGATTT TGTTGAGACA TATTTTCCTC ACGCTTGCAT 180
ATATATATAT TTTGCTTGTT AGTTTGATTA CTGTTGATTT CAAATGCAAT TAATATGATT 240
GTATAACACT TGTAGTAACG GTGCTTATAA TTGGTGGGTG CGACTAGATT TTGGCTGATG 300
CGCCTAAATT ATTAAAGTTA GGAGCACCGG TGCTACCAAG CAGAAAGGTT CATTTCGAGC 360
CCTGTATTGT GTTTCATGAC ATTTTGTTGT TTCATTGCGT TGTGTTTCAT TTTGTTGTTT 420
CATTGCGTTG TGTTTCATTT TGTTGTTTCA TTGCGTTGTG TTTCATTTTG TTGTTTTATT 480
GCGTTGTGTT TCATTTTGTT GTTTCATTGC GTTGTGTTTC ATTTTGTTGT TTCATTGCTT 540
TGCATTGTGT TGCATGGCAT TGCGTGTGTT TTATTGCGTT GCATTGTATT TCAATGCACT 600
GCGCTGCTCT TGACTGATGA AGTCCTCCTG AAGCTGATGT CTCCTGTGCT GTGTATCTCC 660
TCTATTCATC TTTGTCCACC GCTGACAGTG AATGCTCTGC TCTGCTCTGG GCCCCGTGTG 720
GAGGATCTCT GGAGACTCTG GAGACCCTGG CCCCCGTGTG GAGCTCGCTC CGGCTGCTGT 780
CTGGGGGCCA GCGGGTCCCT GTGCTGCGGG TGATGGCAGA CAGACTCCTG CTAAATGTGC 840
TGGAGAGATC TAAATTACCA GAGTGCAGCT GTCATGAGCA GAGTGTGTGT GTGTGTGTGT 900
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGAGAGAGA GAGAGAAAGT 960
GTCAGCGCCT GTGTGTGTGT GTTTGTGTGC AACTTTGTTT GTGTGCAAGT GTGTTTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1080
GTGAGAGTGC AAGTGTGCCT GTGTTTGTGA GTGTTTGCGT GTGCGTGAGT GTGTTTGTGT 1140
AAGTGTGTGT ATGTGTGATT GTGGGTGTGC ATGAGTGTGT GTGCGGGAGT GTGTTTGTGC 1200
GTGCGGGCAT GTGTGTGTGT GCACAAGTGT GTTTGTGTCT GTGTAAATGT TTGTGTACAT 1260
GCACATGTGT GTGTATGAGT GTGTGTGTGA GTTGGTGCGT GTGTGTGTGT GTGCACAAAT 1320
GCGAGTTTGT GTACATGTGT GCGAGTCTGT GTGTGTGTGC GCGCGTGTGT GCCCGTGTTT 1380
GTGTGTGTCT TTGTATGAGT GTGAGTGTTT ATGAGAGAGT GTGTGTGTGC GCTCATTTTT 1440
GTGTGTGTCT GTGCATTGTG TATAAGTGTT TGTGAGAGTG TGTGTGTGTC TGTGTGTAAG 1500
TGTTTGGGAG AGAGAGAGAG TGAGTGTGTG TATGTGTGAG TGTGTGTGTG TGTGGTGTGC 1560
ATGTGTGAGT CTGTGTGTGC ACGAGTGTGT TTCTGTGTGT GCATTTGAGT GTCTGTGTGT 1620
GCACACGTGT TTGTGTGTTT GTGTACACGA GTGTGTGAGT GTGTGTGTTT GTGTGTCTGT 1680
TTGAGTGTGT GTGTTTGTGC ATGCGCACGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC 1740
CCGGCCCATT TCTCAGCTAA TCTCTGTCTC TCTCTCCTCC GTCTGCTGCT GGTCTTCATC 1800
TGCTGGTGTT TTCTGTGATC TCCAGCATCC ATCATGAGTG CAGATCTTCA GCTGTTAGAC 1860
TCCAGCATGT GTTTATCAAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGAGTGTGAG ATTGTGATTG 1920
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TCGCTGCTGC TGCTGTTTGA TATTTAGATG ATCTGAGGAA 1980
TGACAGACAA GTAAAAGGCA TTTCCAGCAT TCTGACACAG AGGAGAATTC AGTCGTCACA 2040
GATTAAATGN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2100
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNC ATCCATCATG 2160
AGTGCAGATC TTCAGCTGTT AGACTCCAGC ATGTGTTTAT CAAGTGTGTG TGTGTGTGTG 2220
TGTGTGTGTG TGTGTGTG 2238