EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04880 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:260957-262906 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RXRGMA0856.1chr17:261096-261110TGACCTTTAAACTG-6.11
RxraMA0512.2chr17:261096-261110TGACCTTTAAACTG-6.01
Sox6MA0515.1chr17:261519-261529CCATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GGTCAGGTTT TGCTCATTAT TCAGCAGAAA CACCACAGGA GAGTAAAGTA AAGATCAGCG 60
CTGCCGCAGG TCATCACACT CAAACCAGAG CATCAGGAAT AACACAACAG AACCGCCTCG 120
TCTGGAGCTC AATGATGCCT GACCTTTAAA CTGAACCCCT TACACACAGA CGGAGCACAC 180
TCAGGTGTGT GTGTGTGTGT GTTGTACTCA CGTCATTGTC GTGTCCAGTC TTGGCCAGCA 240
TCTCCTGCAG CGCTCGCACA GACAGAGACT GCTCCAGGAC AAAACTGCAG ATGCACAGAT 300
CTGGAGGAGC ATACTGCAAA CACACACCAC AGGTCAGTAT ACAAGATCAA CACACGCACG 360
CACAAACGCA CACACACACA CACACAAACA CAAACACACA CAAACACACA ATCACAAACA 420
CATATACATC CACACATACA TACAAACATA CACAAACTCC CACACACACA TATACACACA 480
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAAAGGGTTG TTTTGTGAAT 540
TGTCGGATCA CTCCACAGGT TCCCATTGTT TTAATACTGT TCAAACAAAA GCGCACACAC 600
GCAAACACTC ACACACACAC ACACACACAC ACACACAAAT GCACCCACAT GCACATTTAT 660
ATATGTGTAG ACACACACAC ACATTTATGC ACAAATACAC ACACATGCAT AAACATGCAT 720
GCACAAATGC ATACACGCAC ACACACATGC TCACAAATGT ACACACTCAT GCACATGCAT 780
ACACACACAC ACACGTGCGC ACAAGAACAA ATGCATCCTC ATGCACAGAC ATGCACTTGC 840
ACGCACACAT TCACATATAG ACATGCACAC ATATTAATTC ATGCACATGC ATGCACACAC 900
ACAAATGTAC ACACTCATGC ACATGCATAC ACACACATGC ACACACATTC ACATGTACAC 960
ACGCACACAA ATTCACGCAT ACACAGACAA CCACATGCAC ACACTCATGC ATAAGCACAC 1020
ATATTTATAC ACACAAATGC GCACACACAC AGACCAAACT GCACACAGTC ACATATGCAT 1080
GCACAAATTC ACACATGCAC ACACACATGC ACACATACAC ATGAGCATAG TATACACACG 1140
CGCATGACAA ATTCATGCTC GCACACGCAC AGAAACGTAC ACACTTATGC ACATGCACAC 1200
CCAAACACAC ATGCATGCAC ACAAATGCAT CACGTACATG CACAAATGCA CACAGACATT 1260
CACATACACA CACACACAAA TTCACACATG CACAGACAGA AAAACATGTA CATTCACATG 1320
AACACAAATG TACACACTTA TGCACATGCG CGCACGCACA CATGCATGCA CACACACACA 1380
AATGCATGCA CAGTCACATA TACACACACA CACACACAAA ACGTGTACAC ACACACACAT 1440
AATAAAGAGC ATATACACAT ACTATATAGA GCATAATATA CACACATGCA TGCACACTAA 1500
CAAATGAATG CACATGCACG TAAATACATG CACATGCACA CACACATTCA CACACACAGA 1560
AACACATACA CACACATACA CATGAGCATA TACACACAGG TATGCACATA CACACACACA 1620
CACGCACACA TACATACACA CTATGGTGGT TAAAAATATA GGATATTAAG AAAACAAGTG 1680
ATCATTAAGA GTCTAAAGCT GCACTACAGT TCAGAAACCG CTGAAGACCA CCAGAGGGAG 1740
AAAGCATGAT ATATATTAAC CAGCACCTTC ACTTCTGTTC AACTGAAGAG AGTAATGAAC 1800
ATCTCGGATG ACAAGCGGAG AGTAAACGAT GAGGGAAACA GAGCTGATGC TTCAATGCTG 1860
CGCTGAAGCC AAACACACAC CGCTGACAGT ATGAGGTGAA CAACCAGAAG ATTTAATGAG 1920
AGCTGCGTTA CTGAGGAGAA CTAAACTGG 1949