EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04876 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr17:55587-56789 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr17:55915-55927AAACAAACATAC-6.37
Foxd3MA0041.1chr17:56183-56195AAACAAACATAC-6.37
POU2F2MA0507.1chr17:55599-55612AAATGCAAATGAG-6.28
Enhancer Sequence
GACTGTTGCT TTAAATGCAA ATGAGATTGT GGTGTTTTCA GAAGAGGGCG GAGCTACAGA 60
CAGCTGTGAG TCCCAATAGC GACAGATGTA AAGCAACACT ATGTGTGTTG TCAGTGTTGG 120
TCAGGTGTAT GTTATGTTGT TACTCTATTT TATGTGTTAT GTTGTTATGT TACTGTATGT 180
TATGTTGAGT GATATGTTGT GTTGTGTTAT GTTACTGTNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 300
NNNNNNNNNN NNNNNNNNAT ACACACACAA ACAAACATAC ACACACAAAC ACACACTCAC 360
AAGCACAGAA ACACACACAA AACTTTAACT TACACAAACA CCCACTCACA AATAAATACA 420
CACACACACA TACGCAGAAA CAAACATATA CACACAAACA CCCACTTACA AATAAACACA 480
CACACACACA AACACACACA AACATACACA TACTCACTCA CATACACACA CACACACACA 540
CACACACAAT ACACATACTC ACACACATAT ACACACACAC ACACACACAC ACACATAAAC 600
AAACATACAC TTACAAACAC ACATGCACAA ACACACTCAC ATTTACATAA CCACACTCAC 660
AAACGAACAC TAACTCACAC ACACAAATAC ACACATTTTC TCACAAACAC ATGCATGCAC 720
AAACAAACTC ACACACACAA ATACACACAC AGTCTCTCTC ACACAAAAAC AAACACAAAC 780
TCTGTCACAA ACACGCATAC ACGCAAACAA AAACACACAC AAACCCACAC ACAAACAAAC 840
ACTCTCAAAC ACACACACAC ACACCTACAC ACACGCCGAG GGAGACCGCA GGCGCCAGTC 900
CACCCCTGCT GAGACCCTCT CCATTGGTCA CCCGTTACAG CAGCGTAACC CCCTTCCCTT 960
CATTAGCCGG AGACAATCAG CCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACGCCGAGCG 1020
CTGTTCACAC TCTCCCCCAC ACAAGACCCC CAAACTCGCC TTTGAACACT TTGTGGAGAC 1080
TTCCCCCTCT TAAATCTGGG AGTGGGAAAG GTCCCCATCA CAGTAAAGAG AGAGGGATGA 1140
ATCTGGAAAA TGCAATAAAT CTGAGATCAT AGGCGCGCTC CGGCCTGAGA TAAATTCTTG 1200
CA 1202