EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04831 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:53274519-53275649 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SOX10MA0442.2chr16:53274746-53274757TTCTTTGTTTT-6.62
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr16:53275080-53275091AGCCTGAGGCT-6.02
ZSCAN4MA1155.1chr16:53275245-53275260TACACACACTGTCAG+6.33
Enhancer Sequence
ACATTCATAG TCACTTAAAT CCCCTTTCCT CCCCATTCTG ATGCTCAGTT TGAACTGCAG 60
CAGATCGTCT GGACCATTTC AACATGCCTA TATGCATTGA GTTGCTGCCA TGTGATTGGC 120
TGATTACAAA TGTGCGTTAA TGAGCAGTTG GACAGGTGTA CCTAATAAAG TGGCCGGTGA 180
GTGTATTTGT GTGATCATAT TTTTTTCCGG TGTGGATTTG TAAGAAATTC TTTGTTTTGT 240
TAGTTAAATG TTGTGTTGTT GCTCATTTAG AAACATCTCG GCGTGTTTGT TAGTATAAGT 300
GAGCTGTTGT CTTGGATGAT GATGGGAGTT TGCAGGTATT GTTTGTTGTT CTGCTGGTCT 360
GTGGTTGCTC TGCCGCAGCC CTTTCCTCTC AGCCTGTATA TGTGTGTGCG TGTGTGTGTG 420
TGTGTGTGTG TGTGTGCGTG TGTGTGTGCG CGTGTTGTGT TTGGGTTGCC TGGTTTGTAT 480
GAAACAGCCG GAGGGTTTGG ATTCTGGAGA AGGTTGACAA TCATCAGCTT GTGTTGGGAA 540
TGTCAGAAAT CCTCAATCCA GAGCCTGAGG CTGAACAACA GAGCAGTCTG ACGTCTGGAG 600
GAGCTGTCTC TCACACACAC ACTCATACAA TACACACACG CACACACACA TTCTCTCTCT 660
CTCTCACCAA CACCCATACA ATATTACTTA AACACACACA CACACTTTCA CTTACACAAA 720
CACATATACA CACACTGTCA GTCACACATA CACACTCACA CATCCTCTAA CTCAAACACT 780
CATTTAAACA CACACAGACA CACTTTCTCA CTTACACACT CTCTCTCTCC CTCACACGCA 840
CGCATGCAAG CCCCCAAAAC CCACCGCACA CACACACNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 900
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNTTT CTCGTTCTCG TCCTCCATGC GCAGTCTCTC CTCGATGCAG 1020
TTCCGGGCCT GCAGGAAGGC TTTCCTCTGC GCTCGCTCCG TCAGGATACG CACAAACAGA 1080
CCCGACACAT TCACCCCGGT GAAGAGCAGA GTGTTGGCCA CCAGCTGACA 1130