EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04814 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:51952627-51954063 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr16:51953962-51953980TTTTCCTTCTTTCGTTCC-6.19
FOXE1MA1487.1chr16:51952781-51952796TTTGTTTGTTTAATA-6.93
Foxd3MA0041.1chr16:51952752-51952764GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952756-51952768GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952760-51952772GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952764-51952776GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952768-51952780GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952772-51952784GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952776-51952788GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr16:51952780-51952792GTTTGTTTGTTT+6.32
HLFMA0043.2chr16:51953923-51953935CATTACATAACA+6.32
Enhancer Sequence
AGGGTTTATT ATATTGCACA TTTCATACAC AGTGGCAATT CAAAGGGCTT TACATAAACA 60
GGAATAAAAG AGACAAGTGT AAGAAAATAA AAACAAATAA TGAGAATTAT TAAATAGAAT 120
TAGTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTAATAA ACATGATGAT 180
ATGGATATTT AAACTTGTAT ACTAGTTATT TGTGGCCTAT TAATATGTCA GTTAAAATCT 240
TAGACTAGAT AGATTCTTTG TTTGTTAAAC TGGTAGACTA GTTAGTTTCC GGAGAGTCAT 300
CAGATAAATG GAGCATTAGA AAGATAGATG GATGGATGGA TTGGTTAGTG GGTGGACAGA 360
TGGATGGATG TATGGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 420
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATG ATAGATAGAT AGATGATAGA TAGATAGATA 480
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 540
GATAGATAGA TAGATAGATG GATAAATAAA CAGATAGACA GACAAATGGA TTGATGGATG 600
GATGGACTGA CGAATGGATG GATGGATAGA CAGATAGATG GAAGAAAAAA AAGACAGACA 660
GATAGATAGA TGGATGGAAG GACGGACGGA CGGACGGACG GACAGGCAGA CAGACAGACA 720
GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 780
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 840
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 900
GATAGATAGA CAGACGGATA AATAAACAGA TTGACAGACA AATGGATTGA TGGATGGATG 960
GACTGATGGA TGGATGGATA GACAGATAGA TGGAAGGAAA AAGACAGACA GATAGACAGA 1020
CAGATAGACA GATAGACAGA TAGACAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 1080
TAGATAGATA GATAGATTTT TCATATGCAC TGAGCTCAGT AAAATGTATA TTCTAGCAAT 1140
GTACCACAAG GTGGCGCAGT GAGGTATTTC AGTTCAGATA AGCTTTTATT ACATTTTAAA 1200
ATATTGATGA ATCATCAGCA CAATTCATTT ATCTCAAAAC ACATTAATCC AGCCTCGTAA 1260
AGCAAAAGTT TGAGAGTCGG CTGCAAACAT CCCCTGCATT ACATAACATT CCCCGCTCCA 1320
TGTCTGTTTT TCCTCTTTTC CTTCTTTCGT TCCGCTTTTC TTTGTTTAAC CTAACTCACT 1380
GCTGCTCTGG CACAAAGTCA GAACATTACT GGATGCTCTC CATCTTTCTG TCCTCA 1436