EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04710 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:42592777-42594069 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr16:42593246-42593259ATTAAGTGGATTT-6.2
POU4F1MA0790.1chr16:42593025-42593039AATTAATTATGCAT-7.58
POU4F2MA0683.1chr16:42593023-42593039ACAATTAATTATGCAT-6.75
POU4F3MA0791.1chr16:42593023-42593039ACAATTAATTATGCAT-6.75
Enhancer Sequence
TCTGATGTTA TTTATTTCAG GCTTAATGCG ACGACCTGGT GCACATATCT ATATCCTAGT 60
ATCTAAATTC TAAATTTGTT CGTTTTTTTC TCTCCACAAT TTGAAATAAA AGCATTTCTC 120
CGTCCAGTCA ATATAGACAC TGAGGTGAGG GTGAGATGGA GACAAAGTAG ACCGTCATGC 180
ACTTCGGTGG CATCAGAAAA CCTCTAATCA AATGAAGATG GATTTTGTGC GGTTCATCGT 240
AACAACACAA TTAATTATGC ATGACAGAGA CATTTATTGG GCTCATTTCA CCCGGACTCC 300
ACTAAGTAAC TGGGCAAATC GGGTTAAGGT CGCTGTTGTG CTGGTCGGAC GGCTGTTATC 360
GGGACGGCAG ATCACCGGGC GGCCTCAGTC TGTCTGTCAT TCACGACTCC CGCCTTTTCT 420
CTCTGACAGA CCAAACAAAT GCATCTGCTG AAAAAATTAT TTGGCTTCAA TTAAGTGGAT 480
TTTTCCCGGA ATACAAGTAA GGAATTATAA TAATAATAAA ATGTGATTGA TACTATATCA 540
ATAAGGGGAG GCTGGGTCTA GTTGTCACAT GTGTCTGTCG TCTTGAAGAT TGTTTTTGAG 600
GGACTATTTT GTTTTAGCTA GCATGATATT TGTAGGCTGT GTGGGTTTCA AATAAATGAT 660
AAAAAACATA ATGTCTAATA TTTAAATTTC ATCATTTGTG TAGGCTAATA AAATCAAAGA 720
AATAAAAATT AAAGAAATCA AGTCAAGAAT CAAGAATCAC ACACACACAC ACACACACAC 780
ACACACACAC ACACACAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 840
ACACACACAC CATGAAGATA TAGCCTAGTT AAACGGCAAC AGAAACAAGT TTGTATGCAA 900
AATAGGCCTA TTGCGATACA TTTCGGTAAT TCCTTTATTT GAAATTTAAT AGCCTACTTA 960
TGGATGTATT TACATTAATA ATTATGTTAA GTATATATCA TTCATTTTCT TGTCGGCTTA 1020
GTCCCTTTAT TAATCCGGGG TCGCCACAGC GGAATGAACC GCCAACTTAT CCAGCAAGTT 1080
TTTACGCAGC GGATGCCCTT CCAGCCACAA CCCATCTCTG GGAAACATCC ACACAAACAT 1140
TCATACACAC ACTCATACAC TACGGACAAT TTAGCCTACC CAATTCACCT GTACCGCATG 1200
TCTTTGGACT GTGGGGGAAA CCAGAACACC CGGAGGAAAC CTACGCGAAG ACAGGGAGAA 1260
CATGCAAACT CCACACAGAA ATACCAACTG AG 1292