EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04231 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:3303650-3304693 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr16:3304412-3304428CGATATGTAAACAAAA+6.22
FOXA1MA0148.4chr16:3304493-3304509CGATATGTAAACAAAA+6.22
FOXC2MA0846.1chr16:3304028-3304040TATGTAAACAAA+6.74
FOXC2MA0846.1chr16:3304102-3304114TATGTAAACAAA+6.74
FOXC2MA0846.1chr16:3304415-3304427TATGTAAACAAA+6.74
FOXC2MA0846.1chr16:3304496-3304508TATGTAAACAAA+6.74
FOXK2MA1103.1chr16:3304029-3304040ATGTAAACAAA+6.32
FOXK2MA1103.1chr16:3304103-3304114ATGTAAACAAA+6.32
FOXK2MA1103.1chr16:3304416-3304427ATGTAAACAAA+6.32
FOXK2MA1103.1chr16:3304497-3304508ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr16:3304029-3304040ATGTAAACAAA+6.14
FOXP2MA0593.1chr16:3304103-3304114ATGTAAACAAA+6.14
FOXP2MA0593.1chr16:3304416-3304427ATGTAAACAAA+6.14
FOXP2MA0593.1chr16:3304497-3304508ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr16:3304494-3304511GATATGTAAACAAAAGC+6.03
SOX10MA0442.2chr16:3304181-3304192AAAACAAAGCA+6.02
Enhancer Sequence
AGCGATATGT AACAAAACAA CATGTAACAA AAGTGATATG AGATAAAACA AAACAATGCT 60
TAAAATGATA CGTAACAAAA CAAAATTATA TGTAACAAAG GGATTTGTAA CAAAACGATA 120
TGCAACAAAA AATATTTAAC AAAACAAAAC AATACATAAC AAAATTATAT GTAACAAAAC 180
AAAATAAAAT GATATGTAAC AAAGTGATGT GTAAACAAAA CAATACACAA AATAAAGTGA 240
TTTATAACAA AGCGATATGT AACAAAACAA TATGCAACAA AACAATGTGT AACAAAACAA 300
AGCGATATAA AACAAAACAA AACGATACTT AACAAAATGA TATAACAAAA CAAAATAAAA 360
TGATATCTCA CAAAATGATA TGTAAACAAA ACAAAACGAT ACTTAACAAA ATAATATAAC 420
AGAACAAAAT AAAACGATAT CTTACAAAAT GATATGTAAA CAAAACAAAA CGATACTTAA 480
CAAAATGATA CGTAACAAAA TAAAATGATA TGTGACAAAG CGATATGCAA CAAAACAAAG 540
CAATTTAAAA CAAAACGATA CATTACAAAC TTATGTGTAA ATAAAATGAT ATGTAACAAA 600
GCGATATGCA AACAAAACAA CACAAAACAA AATGATACTT AACAAAATGA TAAGCAACAA 660
AACAAAATAA AATGATATGA ACAAAGCGAT ATGTAACAAA AACAAAACAA AATGATGCTT 720
AACAAATTGA TTTGCAACAA TATAAAATGA TATGTAACGA AGCGATATGT AAACAAAACA 780
AAAACAAAAC GATACTTAAC AAAATGATAT GCAACAAAAC AAAATAAAAT GATATGAACA 840
AAGCGATATG TAAACAAAAG CAAAACATTC AATCTTGCCT ATATCAAAAA CGAACCATTC 900
TGAACATGCT GTAGCTCACA CCACACCAGT TTGCAATGCT GGATTTTTGG AGGAACACAG 960
AACTGTTGAA CTATGTCAGA ACTTGCGACT GTTTGTCGGC TAACAATGCA ATGCTTCCCT 1020
GCACAGCGAG ATCAGTTTCA GGT 1043