EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04225 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:2258121-2260007 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr16:2259525-2259537AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr16:2259607-2259619AAACAAACAAAC-6.32
GSX1MA0892.1chr16:2258179-2258189TTTAATTAGG-6.02
RREB1MA0073.1chr16:2258498-2258518CACCCAAACACACACACACA+6.36
RREB1MA0073.1chr16:2258556-2258576CACCCAAACACACACACACA+6.36
RREB1MA0073.1chr16:2258718-2258738ACACAAAACACACACACACA+6.71
Enhancer Sequence
ATAAAGATAT TTGTGTCCAC GCAGACGGCT GATAGTGATC TGCTTATGTT GAGATGTTTT 60
TAATTAGGCA TGACTCCTTG TGACCAGCAG GTGTCCTCGG TGTGCTGCGA CCTCATCTGA 120
ACCTGCTATG GGGTATATGA CCTTTCAGTG TGGTAAATGG CACTGACGTG TGTTGTACCT 180
GCTGCAGACG TGGTCAATGA GCAGCGAGAC GTTGTCCAGG CCGCTGTCCA GCTTGGTGTT 240
GTGGTAAAGA CATCGATCTC TCTGCAGCTC CACCGCCTGA CGGAGCAGAG TCTGCAGCCG 300
CCGAGGAGGC AGCATCACTG ACGGAGGGAG ATACGCTGTA CAGCACACAC ACACAGACAC 360
ATGCACACAC GCACAAACAC CCAAACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACAGACACAT 420
GCACACATGC ACAAACACCC AAACACACAC ACACACACAC ACAGACACAC ACACAGACAC 480
ATGCACACAC ACGGACACGC ACACGCACAT TCAAAATCAC AAGCACATGT GCGCACATGT 540
ACAGACAGAC ACACACACAC ATACATACAT ACATACATAC ATACATACAT ACAGAAAACA 600
CAAAACACAC ACACACACAC ACAAACACAC AAACACACAC CGTTACAGAC ATACACATGT 660
ACAGGAGCAC ACACATACAG ACACAAAAGC AAACACACAA ACAGACAAAA CACATAAACA 720
ACACACAGAC AGACACAAAC ATACACACAA ACAAACAAAA CACACACAGT CAAAAACAAA 780
CACGCACAGA CACACACAAA AACAAACACT CACACAAACA AAACACACAC ACACAAACAC 840
ACAAAAACAA ACACACAAAC ACACAAGCAG ACAAAACACA TAAACAACAC ACAGACAGAC 900
ACAAACATAA ACACAAACAA ACAAAACACA CACAGTCAAA AACAAACACA CACAAACACA 960
CACACACCCA GACACACACA CACAAAAAAC ACAAACAAAC AAAAACAGTC AAAAACAAAC 1020
ACACACACAA AAAACAAACA CACACACACA AACAAACACA CACAAACAAA ATAAACACAT 1080
ACACACACAA ACACATACAC ACACAAACAC ACACAAAAAA CAAACAAAAA CAGTCAAAAA 1140
CAAACACACC CACACACACA CAAACAAACA CACACACACG CACACACAAA AAACAGCCAC 1200
ACACAAACAA AAACAGTCAA AAACAAACAC ACACAAACAA ACAGACACAT ATAGTCAAAA 1260
ACAAACCCAG GTGCACACAC ACACAAACAC ACCCAGACAC ACACACACAA AAATAAACAC 1320
AAACAAACAA AAACAGCCAA AAACAAACAC GCACACAAAA AACAAACACA CACAAACAAA 1380
ATAAACACAT ACACACACAA ACACAAACAA ACAAACACAC GCACACACAA AAAACAAACA 1440
CACACAAAAA AACAAACACA CACACACAAA CACACGCACA CACAAAAAAC AAACAAACAC 1500
AAACACATAC GTACAAACAA ACACACACAC ACACACACGC ACGCACGCAC ACAGACAGAC 1560
AGATGGAGCA GAGAGGCCGT GGAGGGTTAG ACTCAGTTTG ATCTGAATTC AGCCTGAACA 1620
CAGGACACAA AGTGAACACT GTTTCTCCTC AACACTGTTT TGTTTATACG CAGCGCCCAG 1680
AACTCAGTTC GTCTCCTGAA TCGGCTGAAC TAAAATAGAA CTGAACCGAA CCCGAGCTGA 1740
AAAAACAGAT TTACATGACA CTGTGAAGAA GAGGAAACCA GAGGAGGGAA TGAAGAGAGG 1800
AGGAATGAAC AGAATAACCA AAAATCAACA TTATTATTTA TTAATGCTAC TAGTGATACT 1860
AATGTTTATT ATTATGATGC TACTGA 1886