EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04206 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:1118963-1120241 
TF binding sites/motifs
Number: 62             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr16:1119809-1119826ATTAATTAATTAATGGA-6.01
Alx1MA0854.1chr16:1119806-1119823TGAATTAATTAATTAAT+7.27
Alx1MA0854.1chr16:1119834-1119851TGAATTAATTAATTAAT+7.27
ArxMA0874.1chr16:1119805-1119822ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr16:1119833-1119850ATGAATTAATTAATTAA+6.04
ArxMA0874.1chr16:1119841-1119858ATTAATTAATTAATGAA+6.09
ArxMA0874.1chr16:1119842-1119859TTAATTAATTAATGAAT-6.41
ArxMA0874.1chr16:1119806-1119823TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr16:1119834-1119851TGAATTAATTAATTAAT-6.7
ArxMA0874.1chr16:1119810-1119827TTAATTAATTAATGGAG-6.87
ArxMA0874.1chr16:1119809-1119826ATTAATTAATTAATGGA+7.17
DUX4MA0468.1chr16:1120014-1120025TGATTGAATTA-6.14
Lhx3MA0135.1chr16:1119807-1119820GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr16:1119835-1119848GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr16:1119811-1119824TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr16:1119843-1119856TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr16:1119839-1119852TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr16:1119808-1119821AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr16:1119836-1119849AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr16:1119840-1119853AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr16:1119809-1119819ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119813-1119823ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119837-1119847ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119841-1119851ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119845-1119855ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119809-1119819ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119813-1119823ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119837-1119847ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119841-1119851ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr16:1119845-1119855ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr16:1119903-1119916GAATGAATGAACT-6.13
ZNF24MA1124.1chr16:1119771-1119784AAATGAATGAAGG-6.18
ZNF24MA1124.1chr16:1119899-1119912CAATGAATGAATG-6.59
ZNF24MA1124.1chr16:1119967-1119980CAATGAATGAATG-6.59
ZNF24MA1124.1chr16:1119351-1119364GAATGAATGAAGG-6.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119387-1119400GAATGAATGAAGG-6.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119295-1119308GGATGAATGAATG-7.04
ZNF24MA1124.1chr16:1119939-1119952GGATGAATGAATG-7.04
ZNF24MA1124.1chr16:1119383-1119396TAATGAATGAATG-7.12
ZNF24MA1124.1chr16:1119435-1119756TAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGGAGCGATAAATTAACAAATGAATGAATGAAGGAAGTGATGAATAAATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAAGGGAGCAATAAATTAACAAATGAATGAATAAAGGGAGGGAGTGAGTGATAAATTAATGAACGAATGAATAAATGGAGTGATAAATGAATAAATAAATTAATGAATGAATGAGGGGTGTGTTAAATGGAGGGATGAATAATTTAATGAATGAATGAATGAATGATGTGATGAACGAATGAATGAATGAATTAATGAATGAAGGGAGCAATG-7.12
ZNF24MA1124.1chr16:1119879-1119892TAATGAATGAATG-7.12
ZNF24MA1124.1chr16:1119883-1119896GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr16:1120131-1120144GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr16:1120127-1120140AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr16:1119975-1119988GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr16:1119299-1119312GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119303-1119316GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119307-1119320GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119311-1119324GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119315-1119328GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119319-1119332GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119323-1119336GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119327-1119340GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119331-1119344GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119335-1119348GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119339-1119352GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119343-1119356GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119347-1119360GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119439-1119760GAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGGAGCGATAAATTAACAAATGAATGAATGAAGGAAGTGATGAATAAATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAAGGGAGCAATAAATTAACAAATGAATGAATAAAGGGAGGGAGTGAGTGATAAATTAATGAACGAATGAATAAATGGAGTGATAAATGAATAAATAAATTAATGAATGAATGAGGGGTGTGTTAAATGGAGGGATGAATAATTTAATGAATGAATGAATGAATGATGTGATGAACGAATGAATGAATGAATTAATGAATGAAGGGAGCAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119443-1119764GAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGGAGCGATAAATTAACAAATGAATGAATGAAGGAAGTGATGAATAAATGAACGAATGAATGAATGAATGAATGAAGGGAGCAATAAATTAACAAATGAATGAATAAAGGGAGGGAGTGAGTGATAAATTAATGAACGAATGAATAAATGGAGTGATAAATGAATAAATAAATTAATGAATGAATGAGGGGTGTGTTAAATGGAGGGATGAATAATTTAATGAATGAATGAATGAATGATGTGATGAACGAATGAATGAATGAATTAATGAATGAAGGGAGCAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119755-1119768GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr16:1119971-1119984GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
GCAATGGGAA ACAGATGGGA GGACAGCTGA GTGAGAATGA CATGCCGGAT TTATCCCAGT 60
GCGCTGCTGT TTTTGGGGCG TCGCGGGTGT GGACAGAGAG AAATGGGGGA TGATCATTCA 120
GCAGATCGAC GCCTTCAGAT AGTCCTGGAA AAGCTGTGGT TCACAGGCAG ACTCTGATGA 180
CACTCATGCT GCTGTCACTC CACTGTATTT AGTGCACATT CTGTCACTCT AACTTATGCC 240
TTGACAGTTT AAGTGCTGGC TCACAGCCAG GGTCTAGTTT TTCAACACAC ACATATAATA 300
GTGCTTCTTG AGTAGCACCA AAACATTGCT AGGGATGAAT GAATGAATGA ATGAATGAAT 360
GAATGAATGA ATGAATGAAT GAATGAATGA ATGAATGAAG GGAGGGGGCG ATATATTAAC 420
TAATGAATGA ATGAAGGGAG TGATGAATAA ATGAACGAAT GAACGAATAA ATTAATGAAT 480
GAATGAATGA ATGAATGAAT GAATGAATGG AGCGATAAAT TAACAAATGA ATGAATGAAG 540
GAAGTGATGA ATAAATGAAC GAATGAATGA ATGAATGAAT GAAGGGAGCA ATAAATTAAC 600
AAATGAATGA ATAAAGGGAG GGAGTGAGTG ATAAATTAAT GAACGAATGA ATAAATGGAG 660
TGATAAATGA ATAAATAAAT TAATGAATGA ATGAGGGGTG TGTTAAATGG AGGGATGAAT 720
AATTTAATGA ATGAATGAAT GAATGATGTG ATGAACGAAT GAATGAATGA ATTAATGAAT 780
GAAGGGAGCA ATGAATGAAT GAATGATTAA ATGAATGAAG GGAGTGATGA ATAAATAAAC 840
GAATGAATTA ATTAATTAAT GGAGTGATAA ATGAATTAAT TAATTAATTA ATGAATGATG 900
TGATGAATGA AGGGATTAAT GAATGAATGA ATTAATCAAT GAATGAATGA ACTGAGTTAT 960
GAATTATTGG AATAATGGAT GAATGAATGC AGTGATGAAT GAATCAATGA ATGAATGAAT 1020
GAATAGACAG ATAAACGCAG ATAGTGATGA ATGATTGAAT TAAACGATGA AATAATCGCT 1080
TTTAAAGTCA ACTAATCACT TTTAAAGTTG GCGGTTCATT CCGCTGTGGT AGCCCCTGAT 1140
GAGTAAAGGA ACTAAGCTAA AAGAAAATGA ATGAATGAAT TAGTGATTTT GACTATAATG 1200
CCATAATGTA CACCTTTTGT AAAGCTGCTA TGAAATGAAG CGCTTTACGA ATAAACTTGA 1260
ATTGAAATGA ATTGCTGC 1278