EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04189 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr16:548301-549685 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr16:548791-548803TGTTTACATTGT+6.04
RARAMA0729.1chr16:548635-548653ACTTGAACTAGTGACCTT-6.43
RargMA0859.1chr16:548637-548653TTGAACTAGTGACCTT-6.07
Enhancer Sequence
CTTCATTTAC CCTCATGACT AAATGATTAT TGATTTCATA TTCTGAACTC GCAGATGTGA 60
ATGCCAGGCA GCGGACGCGG TCTGAAGTAC TGCTGCTTCT GTCAAGTACA GTTCTCTCTC 120
TGGCCTGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 180
ACACACACAA ACTCACTGGA CAATTTAGTT GATCAGTTCC CCTATAGCGC ATGTGTTTGG 240
ACTGTAGGGG AAACCGGAGC ACCCGGAGGA AACCCACACC AACACGGGGA GAACATGCAA 300
ACTCCACACA GAAACACCAA CTGACCCAGC CGAGACTTGA ACTAGTGACC TTCGTGCACA 360
TTTTGTGGCA TCTGTGTTGT GTTTGTGTTT GTTTAGCACT GAATGTCAAG GCCTTCCTGG 420
TGTGTGTGTG TTTGTGTTTG TGTGTGTGTT TGTGTGGTGT CTTGAGGTAT TTGTGCTGCG 480
TGTCTGTTTG TGTTTACATT GTATGTCAAG GCCCTTGTGG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTGTGTGGT GTTTTGAGGT CTTTGTGTGG GTGTGTTTGC 600
ACTGTGTGTA TGCGAGTTTA CAGTGTATTT CGACATCTGT GTGTGCTGTA TTTAAGATCT 660
ATGTGTGATG TTTGTGGTCT ATGTCAGGGT CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT 720
GTGGTGTATT TGCTGGTCTG TGTGTGATGT TTGTGGTGAT TGTGCTGTAT TACAATGTCA 780
TTTTGTGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TAGTGTATAC TGAGGTCCTT GTGTGATGTA 840
CGTTGGGGTC TGTGTGTGGT GTGTGTGTGT GTGTTTGCGA TTCATGTTGA GGTCTTTATA 900
CGGTGTTTGT GTTGTATGTG GAGGTCTCAG TGTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 960
GTGTGTTTGT GCTGTGTGTT GTGTGTGTGA GTGTGTGTTC TGACCCACTG AGAGTGCTGT 1020
GTGTGTCTGC TTGTCTCCTC AGGCTGGTGT GATGGTGCTG ATGGCAGCAG AATCTCCTCT 1080
TCAGGCCTGT AATCAGCAGC GCTCCATGTG TTTGGCAGCA CAGGGGTTTC CAATCGACTC 1140
TTGCCCCTGG TGTAAAACCC TGAACAGAAT CAGTGTGTGA GCGTTCCTCA GGGCGAGCAG 1200
CGTTCCTTCT AGAGAGAGTG TGTGTGTGTG TGCAGGAACA CAGATGTTCT CTGAGCTCTA 1260
CAGACGCTCC ATTTGTTCAA CATGCTGCAG GAGGCCATGG CTGTTTCCGA GACCGCTTCA 1320
ACACAAAACA GCAGCAGTGA AAACACTTTT GTCTTTGCGT TCTCCAAAAC AGGCATGAAT 1380
TCCT 1384