EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04179 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:47617887-47619781 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYBMA0502.1chr15:47618431-47618446CTGATTGGTGGATTG-6.19
ZNF143MA0088.2chr15:47618450-47618466CAAAGCATCATGGGTA-6.4
ZNF143MA0088.2chr15:47618215-47618231ATCCCATGATGCATTG+6.71
Enhancer Sequence
ATCCGATTGT TAGAGCGTAT GCTGAGCTCG CATTTTTTGG TCTCTGCAGT TTGACGTGAA 60
CGAGAAAACG TACTTCAAGA ACATCCTGAA CAGCATCAAG TACAACATCA AACTCTCCAT 120
CAAGAAGATC CACAAAGAGG TGGACAAGAC CACGTACGTA ACGCACACAC ACACACACAC 180
ACACACACAC ACACACAGGA AGTGATGTCA CTGATTCACA AGAGTGACTG TTGTGTTTTT 240
ATTCTTCATA GGGGGTTTAA AAAGTTATAA CCTCAACTTT ACATATTTAG ATTTGAAGCA 300
TAAATGCATT AATGAGGGAA GAACTACAAT CCCATGATGC ATTGCTAAGC ACACACTCAC 360
ATTCAAACAT GCCACATATA TGAAATATTC ATTTAAAGTT TGTTATTTCA TTTAAAATAT 420
ACATTTAAAC ACAAATATTT CACTATTTTA TGAACATATT GAGATTCGAT TACTCAATTA 480
GTGGTGCTTT ATGGCAGTGG GCGGAGCCAA AGCGCTTTTA TGGTGAGGTT TGCTAACTGT 540
GAATCTGATT GGTGGATTGC ATGCAAAGCA TCATGGGTAA TGTAGTTTTT CTGCACACAT 600
TTTACTACAC ACACGTGCAC ATAAACATCC ACACACTTAC ACACACACAC ACTTGCTCTC 660
TTTCTAACAC ACACACACAC ACACACACAC AAACATCATG CAAACACACT GACTCATACA 720
CACTCACATT CACTCACTTA CACATACACA CACACACACT CACACGCACA GACTCTTGCT 780
CTCTTGCACA CACGGTCGCA CACAATCACA CACACGCACA CACACACACA CACACACACA 840
CACACACACA CACACGCACG CACGCACACA CACACACACA CACACACGCA CACACACACA 900
CACACACACA CACACACACA CTTAAATTAT ATGAACATAC CACATACACT ATGTACACAA 960
TCACACACAC GCACACACAT ACATACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1020
TTAAATTATA TGAACATACC ACATACACTA TGTACACAAT CACACACACG CACACACATA 1080
CATACACACA CACACAAACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1140
CACACACACA CTCACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1200
CACACACACA CACACACACA CACTTACATT ATATGAACAG ATCACATACA CTATGTACAT 1260
ACAGACAATC ACACACACAC CCACGCGCAC ACACACATAC ATACACACAC ACACACACAC 1320
ACGCACACAC ACTTACATTA TATGAACACA CGACATACAC TATGTACACA GACAATCACA 1380
CAAACGCACA CACACACACA CACTCACATT ATACGAACAC ACCACAAACA CTGTGTACAC 1440
ACAGATAATC ACACACACAC ACACACACAC ACACACANNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1500
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1560
NNNNNNNNNN NNNNNNNCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACATGC TTACAGTATA 1620
CAATTAATCA AAAAGAACTA TGAATACACA GACAATCACA CACACACACA CACACACACA 1680
CAAACATTTA CACACATTTG CTCACCCTCT AACAAACACA CACACTAGTG GACCACAATT 1740
AAAGCAGTAG TGTGTGTATG TGTGTGTGTG GTGCATGCTC GTGTGCGTTT GTGTTTCCAC 1800
AGGTGGCTTC TTCCTCCACA GGCATTAAAT GCGTATTACC TGCCAAACAA AAACCAGATG 1860
GGTGAGTGTG AGCACACACA CACACACACA CACA 1894