EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04160 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:47109696-47111855 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr15:47111498-47111513GGGTTCAAAGTTCAA+6.48
HNF4A(var.2)MA1494.1chr15:47111505-47111520AAGTTCAAAGGTCAC+7.23
HNF4GMA0484.1chr15:47111504-47111519AAAGTTCAAAGGTCA+7.07
HNF4GMA0484.1chr15:47111497-47111512AGGGTTCAAAGTTCA+7.64
Hnf4aMA0114.3chr15:47111498-47111514GGGTTCAAAGTTCAAA+6.98
NR2C2MA0504.1chr15:47111504-47111519AAAGTTCAAAGGTCA+6.06
Nkx3-2MA0122.3chr15:47111405-47111418ATAAACACTTAAA+6.71
Nr2f6MA0677.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
RXRBMA0855.1chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.91
RXRBMA0855.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.14
RXRGMA0856.1chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.96
RXRGMA0856.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
RxraMA0512.2chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.84
RxraMA0512.2chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
TCF7L1MA1421.1chr15:47111504-47111516AAAGTTCAAAGG+6.37
Enhancer Sequence
ACACACACAC ACACACACAC CAGAACAATA CACACATACC AACATAACAT TACCGCAGAG 60
CAAACACACA CACTCATTCA TCAGGACATA AGTAAATCAG CTTCCATGTG TGTGTGTGCG 120
CAAGTGTGTG TGTGGTACAA AGCTGGCCAT TAAGCAAGGT AAAACTGCTG TAACACAAAG 180
AATGTGAAGA GACACACAAT CATCATCTCC TGCTCATTCT CTCGCAGTAT ACTGCTGGGT 240
GGGTCTGACT TAGCATTCCT TAGGCTTCAG CACGTGCACA TGCACACGCG CGCACACACG 300
CGCGCGCACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 360
CACACACAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAAACAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 420
GAGAGAGAGA GAGAGAGCTA AAACACATGC ACAACACAGA GAAAACTAAA ATATGAACAT 480
TAAAACACAC TTTAAATCAT TACACTGTTG TAAAACATGA ACATAACACT AAAACACACA 540
GACACACACC ACACACGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTA ACAATTAAAA 600
CAAAAAACTA AGTCATGCAC ACTTAAAACA AACACACACA CACACACACA CAACACACAA 660
AACACACTGG TATAACATAT TAACACTTTA AAACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACAACAAAGC ACATTAATAC ACACTCATAC ACACTCAAAA CACATTAATA CACACTCAAA 780
ACACAATAAT ACACACTCAT ACACACTCAA AGCACACTCA TACACACTCA AAACACATTA 840
ATACACACTC AAAACACAAT AATACACACT CATACACACT CAAAGCACAA TAATACACAC 900
TCAAAACACA TTAATACACA CTCAAAACAC ATTAATACAC ACTCATACAC ACTCAAAACA 960
CAATAATGCA CACTCAAAAC ACATTAATAC ACACTCATAC ACACTCGAAA CACATTAATA 1020
CACACTCATA CACACTCAAA ACACATTAAT ACACACTCAT ACACACTCAA AACACAATAA 1080
TGCACACTCA AAACACATTA ATACACACTC AAAACACATT AATACACACT CAAAACACAT 1140
TAATACACAC TCAAACACAC TCAAAACACA TTAATACACA CTCAAAACAC ATTAATACAC 1200
ACTCATACAC ACTCGAAACA CATTAATACA CACTCAAAAC ACATTAATAC ACACTCAAAA 1260
CACATTAATA CACACTCATA CACACTCAAA ACACATTAAT ACACACTCAA ACACACTCAA 1320
AACACATTAA TACACACTCA AAACACATTA ATACACACTC ATACACACTC GAAACACATT 1380
AATACACACT CAAAACACAT TAATACACAC TCAAAACACA TTAATACACA CTCATACACA 1440
CTCAAAACAC ATTAATACAC ACTCATACAC ACTCAAAACA CAATAATACA CACTCAAAAC 1500
ACATTAATAC ACACTCAAAA CACACTCAAA ACACACTAAT ACACTTGTAA TACACATACA 1560
CAGCACTTTA AAACACACAA CAAACATTGA CACTTAAAAC ACACAAAAAA ACACATAAAA 1620
TTAAAAACAA ACTTAGAACT CAGTGTCGTC AAACTTAGTT TAAACACACA CACACAAGAC 1680
ATGCCCTCTT AAAACACACA CACACACAAA TAAACACTTA AAAACAAACT AAAAATGATC 1740
CAAACACATC TCCAAAGCAA TGACAGAAAA ACTGCATCCA CTCACCCAGC TGACTGACTC 1800
AAGGGTTCAA AGTTCAAAGG TCACCATGGG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TAATGTATAG 1860
CTTTAAGCGC AGCTCAGAGT CACACAAAAA CACACACCAG AGTCGACAGA GCGTCAGAAT 1920
GAGAGAATGA GGGGTGGGCG AGAGCTGAGA GAGGCTGAGG GGGAGGGGCC TTGAGGAAAG 1980
GGGGTGTGGT CATATATAGC ACTGGTGATG TCACAGTCAG TCTGATGCGC AAACACACAC 2040
ACAGAGAAAC ACACTGCTCT AAAGATACTC AGCTGCTTAT TAACTTATCA AATCATTCAG 2100
AGATTCTGCA GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGC TCTCATTCTG CCTGTCTCT 2159