EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04158 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:47083364-47085226 
TF binding sites/motifs
Number: 38             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr15:47084978-47084993GTGACCTTTGACCTC-6.04
HNF4GMA0484.1chr15:47084979-47084994TGACCTTTGACCTCA-6.55
HNF4GMA0484.1chr15:47084110-47084125TGACCTTTGACCTCT-7.22
KLF9MA1107.1chr15:47084350-47084363GGCCACACCCACA+7.04
Klf1MA0493.1chr15:47084350-47084361GGCCACACCCA+6.62
NFYAMA0060.3chr15:47084255-47084266AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr15:47084250-47084265ATGTCAGCCAATCAG+6.03
NR2C2MA0504.1chr15:47084979-47084994TGACCTTTGACCTCA-7.73
NR2C2MA0504.1chr15:47084103-47084118TGACCTCTGACCTTT-7.82
NR2C2MA0504.1chr15:47085005-47085020TGACCTCTGACCTCA-7.88
NR2C2MA0504.1chr15:47084110-47084125TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2C2MA0504.1chr15:47084117-47084132TGACCTCTGACCTCT-8.73
NR2F1MA0017.2chr15:47084113-47084126CCTTTGACCTCTG-6.74
NR2F2MA1111.1chr15:47084108-47084119TCTGACCTTTG-6.14
Nr2f6MA0677.1chr15:47084103-47084117TGACCTCTGACCTT-7.28
Nr2f6MA0677.1chr15:47084117-47084131TGACCTCTGACCTC-7.42
Nr2f6MA0677.1chr15:47085005-47085019TGACCTCTGACCTC-7.42
Nr2f6MA0677.1chr15:47084110-47084124TGACCTTTGACCTC-8.42
Nr2f6MA0677.1chr15:47084979-47084993TGACCTTTGACCTC-8.42
POU2F2MA0507.1chr15:47084695-47084708ACATGCAAATGTA-6.27
RREB1MA0073.1chr15:47083686-47083706TGTGTTCTGGTGGTTTGTGT-6.14
RREB1MA0073.1chr15:47083794-47083814GTGGTGGTGGTGGTGTGTGT-6.27
RXRBMA0855.1chr15:47084103-47084117TGACCTCTGACCTT-6.55
RXRBMA0855.1chr15:47084117-47084131TGACCTCTGACCTC-6.84
RXRBMA0855.1chr15:47085005-47085019TGACCTCTGACCTC-6.84
RXRBMA0855.1chr15:47084110-47084124TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRBMA0855.1chr15:47084979-47084993TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr15:47084103-47084117TGACCTCTGACCTT-6.58
RXRGMA0856.1chr15:47084117-47084131TGACCTCTGACCTC-6.91
RXRGMA0856.1chr15:47085005-47085019TGACCTCTGACCTC-6.91
RXRGMA0856.1chr15:47084110-47084124TGACCTTTGACCTC-8.12
RXRGMA0856.1chr15:47084979-47084993TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr15:47084103-47084117TGACCTCTGACCTT-6.62
RxraMA0512.2chr15:47084117-47084131TGACCTCTGACCTC-6.88
RxraMA0512.2chr15:47085005-47085019TGACCTCTGACCTC-6.88
RxraMA0512.2chr15:47084110-47084124TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr15:47084979-47084993TGACCTTTGACCTC-8.12
ZSCAN4MA1155.1chr15:47084583-47084598AACACACACTGAAAG+6.67
Enhancer Sequence
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 60
GTGTGTGTGC GCGTGTGCGT GTGTTCATCA GCACCCGATT CCCGCCGTGG CGCCGGTGGA 120
CGAGGAGGGA TCAGACGCAG AGCCGGACCC GGAGGCCGTG CAGAGGTACG AGTGTGTGTG 180
TGTTTGCATG CAGACGCTGC TCTTTCATAC CCACATCAAC ACACACACAC ACACACTCAC 240
ACTTAACTGA GGAGTGTGTT GATGTGGCTC TCTGTGTCCG CTGGTGGTGA AGGTTTGTGT 300
GCACGCGTGC TGGTGGTGTG TGTGTGTTCT GGTGGTTTGT GTGTGTGTGC TGGTGGTGAA 360
GGTGAGTGTG TGTGTGTTCA TGTGTGCTGG TGGTGGTGGC AGTGTGTGCG CACATGTGCT 420
GTTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GCTAGAGAGA AAGTGTTGTA TACTGAGAGC 540
GACATTATGT GTGTGTGTGT GTGCGCGCGC AGGTGGTGAC AGAGTGTCTG TGTGCTGCTG 600
GTGTGTGTGT GTGTGTTTAC GCTGGAGATA TTTGTGTAGG TACACACTGA TATATGTGTG 660
CGGGTCTCCT CTGTCAGACT GCAGCTTCTC CTGTCCGTCA TCAGCATCAC TGGAGCCGCT 720
TCTCTGCAGT CCACTAATCT GACCTCTGAC CTTTGACCTC TGACCTCTCT CTCGTGCCGA 780
CCCGGGCACA CTCCCCTCTG CTTGGCTTGT GTCTGATGGC TTTGCTAACG GCTAACAGCT 840
AGCGCGGCGG CGTACAGCAG CAGATCTGTG TGCCCATTGG CTGTGTATGT CAGCCAATCA 900
GAGCGCTGAT GCTGCTGCTT CCTGTGGTCA GGTATTTGGC GAACAGCTGT AAGCGGCACA 960
CCACACATGG CCCCACCCAC AGCCCCGGCC ACACCCACAG CCCCGCCCTC GGCCCCGGCG 1020
GAGAGCTGTC AGACGCTCAG AGGGCCCGGC AGAGGGGCTG CTGGACCCCA GAACTACACT 1080
GCCGGTGAGG GCCCACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACGCACAT 1140
AAACATATGA ACACATACAC ACACACACAA ATGTACAAAT ATATACACAC AAATACACAC 1200
ACGTATATAT ACACATACAA ACACACACTG AAAGTGTAAA CGCAAACACA TGAACATACA 1260
CACACACGCA CGAATACACA CACACACACG CACACACACA CACACATATA GAAACAAATG 1320
AACACATACA TACATGCAAA TGTACATAGA TACATACACA CACACATATG AACACATACA 1380
CACACAAACG TACATATTTA CACAAACACA CACACACATA TGTACATATA TACACATATA 1440
CATGCATACA AACACACACA CTGAACATAT ATACGCACAC ACATGAACAT ACACGCACGA 1500
ATACACACAC ACACACACAC GTATGTATTA ACGTACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1560
ACACACACAT GCAGTGAGCA GGAAGCTCTG CTCTGTTCAT CACTGATGAA CACTGTGACC 1620
TTTGACCTCA TCATGTAGCA ATGACCTCTG ACCTCACAGT AGCTGTGTGT GTGTGTGTGC 1680
GCGCCAGATG TTCAGATCAC ACCGCAGTGC AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTATGTG 1740
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAAG AAACTGTGCT AGAGAGAGAG TGAGAGTGTG 1800
TGTGAGAATG GGAAAGTTTG TGAGTGACAG AATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTGTTGT 1860
GT 1862