EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04154 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:46940841-46941792 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr15:46941737-46941754ATTAATTAATTAATTTA-6.19
Lhx3MA0135.1chr15:46941736-46941749AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr15:46941735-46941748TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr15:46941739-46941752TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr15:46941740-46941753AATTAATTAATTT+6.92
Lhx3MA0135.1chr15:46941732-46941745ATTTAATTAATTA+6
NR2C2MA0504.1chr15:46940992-46941007AGAGGTCAGAGGTCA-8.73
Nr2f6MA0677.1chr15:46940993-46941007GAGGTCAGAGGTCA-7.42
POU6F1MA0628.1chr15:46941737-46941747ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr15:46941741-46941751ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr15:46941737-46941747ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr15:46941741-46941751ATTAATTAAT-6.02
RXRBMA0855.1chr15:46940993-46941007GAGGTCAGAGGTCA-6.84
RXRGMA0856.1chr15:46940993-46941007GAGGTCAGAGGTCA-6.91
RxraMA0512.2chr15:46940993-46941007GAGGTCAGAGGTCA-6.88
Enhancer Sequence
GTGAGTTGTA TGTACTGTAT ATAAGTGTGT GTGTGTGTTC ACCGTGTCCT GTGCGTCCCT 60
CAGCACTGCG CTCAGCTCTC CGTCTCGAGC GTAACTCAGC GGCGTGTGGC CCAGATCGTT 120
CTTCAGAGAG GGGTCGGCAC CTGCAGCAGG GAGAGGTCAG AGGTCAGCGG CAAGCAGGGG 180
GTCATCAGGC TGCATCCGGA CATCAGCGCA CGAGTGTGTG TGTTTCCTGC TGTGCTTCTG 240
TGTACTGCAG TAAAACACAC TCTGTTCACT GTGACAGAGC TGTTTAACAC TGCCTTCTGC 300
CCTGACCTGA CCCACACACA CTTATACACA CTACACACTA CACACACACA CACACACACA 360
CACACACACA CACACACACA CACACACACG TGCCGATACA GCAGAAATAC AGCTGCAACA 420
CATTTACTAA AAGCTAAAAG TCATCTATTA AAAAAGGTGG ACACAACAGA TATTCAACTG 480
CATCTACTAC AAAAACTGTT ACCCATTAAA AAGTTACACA CACAAACACA CACACTCTCT 540
CTCGCGCGCA CACACACATG CAGATACAGC AGGAAAACAA CTGCTATACA TCTGCTAAAA 600
AGTGATGATA TCTATTTAAA ACGTTATGCA CACACACAAT CACAAACACA CACCTGCAGA 660
TACAGTAGAA ATACAACTGC ACCACTCTCT CTCTCTCACA CACACACACA CATACACACA 720
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACAAACA 780
CGCACACACA CAATCTGATA TGTTATTCAT TATTTTTAAA TATTTTATCA CACAATTTTA 840
TTTCTAGCAA TTGTATTTAA CTTAAACGTT TTGCATTTAT TTATTTAATT TATTTAATTA 900
ATTAATTAAT TTATTTTATT TATTTATTAA TTTATTAAAT TTGTTTATGT A 951