EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04090 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:44546719-44549141 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr15:44548048-44548060AAACAAACATTT-6.27
POU1F1MA0784.1chr15:44548818-44548832TTTATGCTAATTAG+6.98
POU2F2MA0507.1chr15:44547436-44547449ACATGCAAATGTA-6.27
POU3F1MA0786.1chr15:44548819-44548831TTATGCTAATTA+6.92
POU3F2MA0787.1chr15:44548819-44548831TTATGCTAATTA+6.92
POU3F3MA0788.1chr15:44548818-44548831TTTATGCTAATTA+6.82
Pou2f3MA0627.1chr15:44548817-44548833GTTTATGCTAATTAGG+6.04
RFX2MA0600.2chr15:44548878-44548894GGTCTCCATGGTAACA+6.06
RFX2MA0600.2chr15:44548878-44548894GGTCTCCATGGTAACA-6.17
RFX3MA0798.1chr15:44548878-44548894GGTCTCCATGGTAACA+6.21
RFX3MA0798.1chr15:44548878-44548894GGTCTCCATGGTAACA-6.41
RFX4MA0799.1chr15:44548878-44548894GGTCTCCATGGTAACA+6.05
Enhancer Sequence
ACATTATCCT TAGAGATTAT TATGAGGTTT TTATGAGGTG GTTTTGTTAT GATGCTGGTG 60
ACACAATATG ATGTTCCCGC AATTCTACAA TCACCCACTG ACCTAAGAGA ACCGACTAAA 120
CTAATGTGAA CGCTGCCTCG TCATCGCCTG CTAGAAATAT TGATCGTGTC ACACAGAAAT 180
TAAAAGAAAA TGTTGGAATT ATGAGGACAT GTTCATTCTG GAGGTGAACT AATCCTTCAA 240
ACGTCGGCGG TTCCAGAGCG GAAAGTGGGC CGCAGATCTC CATTCAGCAG CTATTCCTGT 300
CTTCATCATG TGTTTATCGG TCAACAGCTT ACATACTGTA CTGTACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACAAATGTAT GTACACAGAA AAACATGCGC GCACACGTAC ACACACACAC 420
ACTTAGACAA ACACATACAT ACACGCAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 480
ACACTTAGAC AAACACATAC ATACACGCAA ACACACACAC ATGCCCACAC ACACAAATGT 540
ATATGCACAG ACAGGCACAC ACAGACATTC AGACACAGAC ACACAGACAC ACACAAATGC 600
AAATAATCAC ATGCATGCGC GTGCCCACGA CCATAAAGTA CACAGACAAA CAGGCACGCA 660
CACACACATC CAGACAGACA CACACGTATA CACAAACACT CACAAGCCCA CACACACACA 720
TGCAAATGTA CACAAACAGA TGGGCGCACA CAGACACAGA TAGGCACACA CACACACAAC 780
TGGAAATGTA CACACACACA CACACACACA ACTGGAAATG TACACACACA CACACTTAGA 840
CAAACACATA CATACACACA CAAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACT 900
TAGACAAACA CATACACACA CGCAAACACA CACACACACA CACACACACA AACACACACA 960
CATACACACA AATGCATACA TACACGCAAA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1020
CATACATACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACTTA GACAAACACA 1080
TACATACACG CAAACACACA CACACACACA CACACACACA TTTACACAAA CACATACATA 1140
CACGCAAACA CACACACACA CACACACACA CACTTAGACA AACACATACA CACACGCAAA 1200
CACACACACA CACACACACA CACATACACT TAGACAAACA CATACATACA CGCAAACACG 1260
CAAACACACA CACACACACA CATTTAAACA AACACATACA TACACGCAAA CACACACACA 1320
CACACATTTA AACAAACATT TAAACAAACA CATACATACA CGCAAACACA CACACACACA 1380
CACACTTAGA CAAACACATA CATACACGCA AACACACACA CACACACTTA GACAAACACA 1440
TACACACACG CAAACACACA CACACANNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1500
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1560
NNNNNNCTTG TGGTGTGTAT TGTTTGAGTT GTGTGTGTGT GTGTGATTGT GTTGTGCATG 1620
TATTCAAGTG TGTTTTCTGT GCATTGTGTA TGTGTGATTG GGTGTGTTAG CTGTGTGCAC 1680
TTCTTGTACT GTGTGTTAGT GTTGTTTGCA TTGTTTGTGT ATGTGTGTGA TTGTGCTTAT 1740
AAGTTAAGTG TGATGGTGTG CATTGTGTTG TGCGAGTGTG TTTGTGTTGT GAATGTACGG 1800
GAGAGTCTGC TAGTGTTGAT CTGTGTGTGT GTTTTGTTGT GTGAGTGTGT TGGTGCTGAG 1860
TGCATTGTTT GTGTTATATT AGTGTGTGTG TGTTTGTTGT GTATGTATGT AAGTTGTGTG 1920
TGTTGTGTTG TGTGTGAATG TATGCGAGTG TTTTAGTGTT GTGTGCAATG TTTGTCTTGA 1980
GCTATTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCAGT GTTTCTAAGT TGTGTCCGTA TAACAGTGTG 2040
TGTTTGTGTT TATAAATTGT GTGTGTTGTG TGTTTTAGAT GCGAGTGTGC CTGTGTGTGT 2100
TTATGCTAAT TAGGTTGTCA AATTGGTCTG ACTGACACAC CCATTTGTAG TGAATCACAG 2160
GTCTCCATGG TAACAAGAGA AAGATGGAGA ATAAGAGTGG CTCTCATAGA AGAGCGAGCG 2220
CTTGACATTT ACCCAACAAA ACGAGGACAG ACACTAAATT ACAGACAAAT AAAGAGAAAG 2280
AGCCTTTTGT TTCCTTTTCA CATTGGTCGT TTAGTTGTTT TTTTTTCCTG ATGTAGACAA 2340
TATCACACAG TGATAATTCA GAGACAGAGA AATCAAGAGA GAAAGAAAGC AATAAACAAG 2400
CATCTTGTGA ACAAACCACA GC 2422