EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-04085 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:44307085-44308562 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307465-44307483CCTTCCATCCATCCATCC-6.49
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307445-44307463CCATCCATCCTTCCATCC-6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307457-44307475CCATCCATCCTTCCATCC-6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307437-44307455CCATCCTTCCATCCATCC-6.6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307449-44307467CCATCCTTCCATCCATCC-6.6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307461-44307479CCATCCTTCCATCCATCC-6.6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307441-44307459CCTTCCATCCATCCTTCC-7.74
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:44307453-44307471CCTTCCATCCATCCTTCC-7.74
LMX1BMA0703.2chr15:44307133-44307144TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr15:44307176-44307189ATTTAATTAATTT-6.07
PBX2MA1113.1chr15:44308394-44308406TCTGTCAATCAA-6.11
Enhancer Sequence
AATTTTAAAT ATAAATATGT TTGATTTATA TAGAAACTGT TTATAACTTT AATTAAATTT 60
GTTATGACAA ATCATATTTA TTTTATTCTT TATTTAATTA ATTTTCAATG TCTATTTATC 120
TGTCTTGGTG TCTATCTGTC GCTCTGTCTC TGTCTATCCA TCTCTCCATC CAGTTGTCCA 180
TCTAGTTGTC TATCTATCTG CCTATCTGTC CTTTTTGTCT AGTTGTGTGT CTATCTGTCT 240
GTCTATTTAT CTGTCAGTCC GTAAATCCAT TCATCTATCT ATCAAACCAT CCATCTATCT 300
GTCTAGTTGT CTGTCTATCT ATCTAGTTGT CTATCTGTCC ATTTATCTGT GTCCATCCTT 360
CCATCCATCC TTCCATCCAT CCTTCCATCC ATCCATCCAT CCATCAATCC ATCCATCCAT 420
CTGTCTAGTT GTCTGTCTAT CTATCTAGTT GTCTATCTGT CTATTTGTCT GTCTGTCTGT 480
CCGTCCATCC ATCCATCCAT CCATCCGTCT AGTTGTCTTT CTAGTTGTCT GTCTGTCTTA 540
TTATCTGTCT AGTTGTCTAT CTGTCTATTT ATCTGTTTGT CCATCCATCC ATCTGTCTAG 600
TTGTCTGCCT AGTTGTCTGT CTGTCTATCT ATCTGTCTAG TTGTCCATCT TTATATTTAT 660
CTGTCTATCC ATTTGTCTAG TTGTCAATCT GTCTAGTTGC CCATCTATCT GTCTGTTTAT 720
CTGTCTAGTT TTCCAGTTGT CTACCTATCT AGTTCTCTAG CAGTCAATGT ATCTATCAAT 780
CAAGTTGTCT GTCTATCTAT CTAGTTGTCT ATCTGTCACT CTGTCCCTGT CCATCTACCT 840
CTCCATCATT CTGTTAGTCC ATCCAGTTGT CCATCTAGTT GTCTATCTAT CTGTCTATCT 900
GTCCGTCTGT CTAGTTGTGT CTATATGTCT ATTTATCTGT CTAGTTGTCT ATCTGTCTGT 960
CTAGTTGCCT GTTTATCTAT ATCTAGTTGT CTATCTATAT ATCCATCTGT CTACTTGTCA 1020
ATCTGTCTAG TTGCCAATCT GTCTGTCTGT CTAGCCTAGT TGTGTCTATC TATCTAGTTC 1080
TCTAGTTGTC AATCTATCTA TCAATTTAGT TGTGTGCCTA TCTATCTAGT TGCCTATCAT 1140
CCAGAACTAA AATTGTACAA ACCTCAAAAT GTCTACTCCA GGTTTTTATT CCCACAAACC 1200
CAGGAATAAA CACTATTCCC ATTTCAGTTA GATCTTGACA GCAGCAATGC AGAGGAAAAA 1260
GACTAGATTT AAAGCCCAGT TCAAACTCTC CTCACTTTAG GTCCGCCCAT CTGTCAATCA 1320
AACATGCCAG TGTGAACAAA ACACACCCAC AAACGGATCA GCCCTGCCCC ATTGTTTGCT 1380
TGTAGAACCA CACTGTTAAA CCTCTCGCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 1440
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCT 1477