EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-03904 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr15:29893376-29895010 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr15:29894315-29894327ATTGTTTATTTA-6.04
Foxq1MA0040.1chr15:29894314-29894325AATTGTTTATT+6.02
IRF1MA0050.2chr15:29893931-29893952AAAATGAAAGTGAAAGTCATG-8.84
NEUROG1MA0623.2chr15:29894010-29894020GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr15:29894010-29894020GACATATGTC-6.02
PHOX2AMA0713.1chr15:29893467-29893478TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr15:29893467-29893478TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr15:29893467-29893478TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr15:29893467-29893478TAATTTAATTA+6.62
TGIF2MA0797.1chr15:29894009-29894021TGACATATGTCA+6.32
TGIF2MA0797.1chr15:29894009-29894021TGACATATGTCA-6.32
ZNF24MA1124.1chr15:29893731-29893744GAATGAATGAAGT-6.06
ZNF24MA1124.1chr15:29893727-29893740TGATGAATGAATG-6.11
ZNF24MA1124.1chr15:29893715-29893728AAATGAATGAATT-6.32
ZNF384MA1125.1chr15:29894271-29894283AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr15:29894270-29894282TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr15:29894269-29894281TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr15:29894268-29894280TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TTATTCACAC AGAACCGTCT AATATGGCAT AACTATAAGG AGCAATGTTT GCGCTGTTTA 60
AACGCAGCTA TGTCAGGATT GGGATAGGTT ATAATTTAAT TATTTAAATT ATGATTGTTA 120
TTATTATTTT ATGACATGTA TTGGGCTATT GCGCTTAAAT AAGTCATCCG TGATTCTAAA 180
TTAATATTTC TATTTATCCT TTTTAGCTAT CACTTTGCTA TCGTCTTTCT CTTCTTTTTT 240
TCTAGTTTTT GGGGTTCTGC CATGGTTAAA TGTTTGCAAA ATGTCTTTAG TTTGTCCAGA 300
TTATTGCTTT TCCTCTAAAA TAGAGACGAA GCAGAAGGAA AATGAATGAA TTGATGAATG 360
AATGAAGTGA TTGACGTTTT TATGCATGTG CGGTGCGGCT TGCTCACGAC AAAGTCGAAC 420
GGGCCGCGAG CTCCAGTGGC CAGTCAGAGC CAGCGCCCCA CAGCAAACTG ATTAAGAGAT 480
GCTGGTTGGC TGCCAATATA TGATAGGAAT TCTTCCAAAG TTTCAGATGA CATCTGGGCG 540
TGTGCATAAT AATGTAAAAT GAAAGTGAAA GTCATGACAT TTGGCCAAGC ATAAGAATAG 600
CCTACAAGAG TGTTTCGATT ATTATATTAA TCATGACATA TGTCATGCTT GGGCTTATAT 660
GAATAACACC TCGCTGTTTA CCATTTCCGA AAGTGGAGCT GACGTCGGCG CGAAATTGCT 720
TGTATAATTG TAAAAAGAGT GATGAATATT AATGGATTTC TTATATCTGT CATTTCTGAT 780
AATATAATTG ATTAGTGTGA GCTTATGAGT TTTCAACACA GCAAAAATGC ATCCAGAATC 840
CTAAACTAAT AACTTTGTCA AGCAAAAATT ATGATTTTAT AAGCTACTGA TTTTTAAAAA 900
AAAAAAACAA GAAAAAAGAA ACTATTAGCT ACCCTAGCAA TTGTTTATTT AAATATGATC 960
ATCTCAAAAT ATAAAATAAA AACATAATGG TTTGACTTTG TGAAATCATA AACCACACTT 1020
GCAGAAAAGA GTTAATAGAA TAAATGAGCA AATACATTCT CTCCAGTAGA TGGCGATTAA 1080
AGCTCAGTAA TACCCCATGA GGATGAATTG AGCTGCTTTG CAGGAACCCA ACCACGCATG 1140
TCAAACCACG CATTATAAAC ATTAATCTTA TGAAACTAGC TCAAGTGACA ACTATATTAA 1200
GTTTAAACCA GTTTAAATAA GTTTATGTTT AATAACTGCA AAAAAGATCA ACATTGCTAA 1260
TCATAAAATA CAAACGGTCG CTGAAAAGTT ATAAATAACG GTTTTCTCGT TTAATAAAAG 1320
CAAAGTCAGT TATAACTGCC TATTATCAAA CGACAGGCGA CTCATTTTAT TACTTATCAT 1380
TGGCTGCGAC ATTGCCACTT TTGCGTTATT AGCCTATCTT TTTCTCGCCT ATAGGCTACA 1440
TAACAATAAA ACAATAATCT GGACAAACTA AGACATTTTG CAAACGTTTA ACCATGGCAG 1500
AACCCCAAAA ATTTGAAAAA AATGTCATAC AATAATAATA TTAACAATCA TAATAATAAT 1560
TTAAATGATG AAAATGTATA ACCTATCCCA ATCCTGACAT AGCTGCGTTT AAACAGCGCA 1620
AACATTGCTC CTTA 1634