EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-03058 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr14:2538087-2540479 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr14:2539403-2539418CACAAAACAAACAAA+6.35
Foxd3MA0041.1chr14:2539407-2539419AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr14:2538935-2538952AAAAAATAAACAAAAAA+6.57
IRF1MA0050.2chr14:2538620-2538641AAAATAAAAGCAAAACAAAAA-6.21
IRF1MA0050.2chr14:2539058-2539079AACAAAAAAGCGAAACCAAAC-6.27
IRF1MA0050.2chr14:2539427-2539448AAAAATAAAATGAAAGCAAAA-6.54
IRF1MA0050.2chr14:2539433-2539454AAAATGAAAGCAAAACAAAAA-6.81
IRF2MA0051.1chr14:2539062-2539080AAAAAGCGAAACCAAACC+6.1
NR1H4MA1110.1chr14:2538323-2538334AAGGTCATTGA-6.32
SOX10MA0442.2chr14:2538593-2538604AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr14:2538955-2538966AAAACAAAGAA+6.62
ZNF24MA1124.1chr14:2540319-2540332ACTTCATTCATTC+6.06
ZNF24MA1124.1chr14:2540323-2540336CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
CAAGCGAGAT CTCTTAAATG CCTCCATCAC TGCTCCTAAA CAGCACTGAA GTTCAAACCC 60
AAAAATCAGC AGGTGGTTTT TGCTTTCTCA GATTCTTCTC CAGAAAAAAA GACTATTCTC 120
ACATTTAGAA AACTTTAGGG AAAATAGGCA ACACTTCAGA ATAGGCCCCA ATAGTTAACA 180
TTAGTTAATG CATTACCAGA AAATGTCTCT TAATAAAAAG TCAGATGATG GCATTTAAGG 240
TCATTGAGTT ATTGATTGCA TGTAGTACTA GAGCATGTGA ATATACTTTA ATCAAAACAA 300
AACAAAATAA AGCCAAAAAG CAAAGCAAAG CAAAACAAAA CAAAAACCAA CCCATCAAAA 360
AAAAACAAAA AAAAAACTTA ACACACAGAA AACTAAACAA AAAACTAAAT AAAACAAAAA 420
ATAACAAAAA AATGCAAAAC AAAATAAATA AAAGCAAAAC CAAACAAAAC AAAATGAAAC 480
AAAAACATAA AGCAAAAACT AAAAACAAAA CAAAGCAAAA AACTAAAACA ACAAAAATAA 540
AAGCAAAACA AAAAATTAAT ACAACAAAAA ATAAATAAAT AAAAGCAACG TAAAACAAAA 600
CAAATAACAA AACACAACTA AAAAGAAAAA AAATAAAGAA AAAAAATGAA TACAAGCAAA 660
ATAAAACAAA AACAAAACAA AAAACAAAAC AACAAAAAAG CACAACCAAA AACTAATAAC 720
ACAACAAAAA AACAATACAA AAAACACAAC AAAAAATTAA ACACAAAAAG CAAAAAAATA 780
TAAAGCTAAA TAAAACAAAA TAAAAAACAA CAACCAAACA ACAAAAAAGC AAAAACAAAA 840
ATCCTACAAA AAAATAAACA AAAAAATAAA AACAAAGAAA AACAAAACAC AAAAAAACAC 900
AACAAGAAAC TAAACAAAAC AGCAAATAAC AAAACAAAAT AAGGCAGAAA ATAAAAGCTA 960
AATAAAATGA AAACAAAAAA GCGAAACCAA ACCAAACCAA ACAAAACAAA ATAAAACAAA 1020
CAATAAAACA CAACAAAAAA CAAATCACAC AAAAACAAAA CAAAACAAAA TAAAGCAAAA 1080
AATAAAAGCA AAATAAAATG AAACAAAGCG AAAAATAAAA CACAACTAAA AAAGGTATAC 1140
ACACAAAAAA CTAACTAAAA ACTAACTAAA CACACAAAAA CGAACTAAAA CTAAACTAAA 1200
ACAAAACAAA AAGCAACAAA AAAGCAAAAA CAACAAAAAC AAACAAAACA AATTAAAACA 1260
AAAAATAAAA AACAAAATTA AAAATTAAAA ATAAAAGCTA AATAAAACAA AATAAACACA 1320
AAACAAACAA ACAACAAAAC AAAAATAAAA TGAAAGCAAA ACAAAAAATG AACACTACAA 1380
AAACAAAATA AAATAAAAAT TTTAAAGATA AAATAAAATA AAATAAAATA AAATAAAATA 1440
AAATAAAATT AAATTAAATT AAATTAAATT AAATTAAAGC AAAAAAAGGG CATATGCCCT 1500
GGCAATATGT CAGTATGTCT CACTGTGATA TTTTTAGTAA CATCTGGACT TGGATTGATG 1560
AGTTTTAGGC AGGTAATACT AATAAACTAA TAAATGTTTT CAAATTATTT CATTGATTGT 1620
AGTTTACCAA TGAAAAGAAT GACTGCAAAG GGCTAAAAGG AGACATAACA AAAGCAGATT 1680
TGTGCCAAAA TATCCATATT TAACTGCAAA CCTTTCAGAC TTCTGATCTA TAAATGCATA 1740
ATAAAAGAAA ACGTTCATCT GGACAATGTT TTTCTGTTCA AAATGAGCCA TAAACATGCA 1800
TCAAATCAGT TTACTCACAC AACGAGATAA CGCACACACA CAGACACACA CACACACACA 1860
CACTTCTCCT TCTAAAAACC CCATCATAGA TCAAACCCTG ATCACAAACA GACCTTCAGA 1920
TAGAGATGCA GCCATTCTCA CGCATGCAGC TATGACGCAA CTGTGATCTA CTACTCAAAT 1980
AAAACCACAG CACACGCCAA ACGCACAGCA CATCTGAAGC CAGCACACGC CGGCCCTCAG 2040
GCCAACAACT GTGCGGATGT GTGTGCGTGC TTTGACAAAT CGGTCCTGCA ACATATCTAC 2100
AGTACTGCAG ACATCACAGC GCTTTCAGTG CAACAAACTG AGATTGTATC AGAACACTAC 2160
ACACACTACA TAAGCAAATA ATGCTAAAGT CTGTGTGAAC TGGACGCTGC AGAGACGTCT 2220
ATATCAGTTT GTACTTCATT CATTCATTTT CCTTCAGCTT AGACTCTCAG AGGTCAGCAC 2280
CTGGTTCCAG CAAGATGTAC CTAATAAAGT GTCCCAAATG CAAGCGATGA CTCTGTCTGC 2340
AACCCCCATT CCCATGCAAA CTACACACAC ATACTCATAA TAGCTTTTCA AC 2392