EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02960 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:50427499-50429407 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr13:50428720-50428732AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:50428924-50428936AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:50428928-50428940AAACAAACATAC-6.37
ZSCAN4MA1155.1chr13:50428074-50428089AACACACACTGAAAA+7.06
Enhancer Sequence
CACAGCTACT CTCAGACTGT CATCAGTACA CACACACGCA CGCACGCACG CAACCACTCA 60
CTCACTCACT CACTCACTCA CACATACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 120
CACACACACA CACACACACA CACACTCCTG ACTCACCGTT GAGCTGCTCC ATGAAACACA 180
CATTTCCGTG CGCGTTGAAG GCCAGTGTGT CCGGCGTCAC ACACAGAGAC TGAAAGAGCG 240
GAGAGAAGCT GATGCTCTGG AGAGAACACA CACACTCCAC ACACACCGAC CACAACTCCT 300
GCTCCGACAG ACCGGCGTCC CGCAGACACA GCACATCCGC CAGAGACACG TTCTCCTGAG 360
GAGCACACAC ACACACACAA ATACTGATCA GAAACATAGA CACTCATCAG AAACACACTC 420
ACATGCACTA AGGAGGAGAA ACACACTGAT CAGACACACA CACACCGACC GATGAAGCAC 480
AAACTGATTA CACACACTGA TCACACACTA AAAAGGTACA CTGATAACAC ACCCACACAC 540
ACACACACTG AGGAGAAACA CACTGATCAG ACACCAACAC ACACTGAAAA AGCACAAAGT 600
GATCACATAC AAACACACAC ACACATACTA AGGAGGAGAA ACACACTGAT CACACACACA 660
CCCACTGAGG AAGCACAAAC TGATTACACA CACTGATCAC ACACACACAC TAAAAGGATC 720
CACTGATAAG ACACACACAC ACACAAAGAA AATACATACA CTGATCAGAC ACACACACAC 780
ACGCACGCAC TGAGGAAGCA CAAACTGATC ACACATACAC ACACACACAC ACACACTTAC 840
TAAGGAGGAG AAACACAATG ATCAGACACA CACACCCACT GAGGAGGCAC ACACTGATTA 900
CACACACACA CTAAAAAAGA TACACAGGTC AGACACAAAC ACACACACAC ACACTCACTA 960
ACACACACAC ACACACACAC ACATACACTG AGAAAAAGTT ACACACACTG ATTGAACACA 1020
CACACATACT GAGAAGATAC ACACACTGAT CACACACACA CACACATACT AAGGAGGAGA 1080
AACACACTGA TCACACACAC ACAAACACTG AGAAAAAGAT AGACACACTG ATCAGACACA 1140
CACACACACA CGCACAAAGA AGAAAATGCA CACACTGATT AGACACACAC ACACATGCAC 1200
TGCGGAGACA CACACTCAGA CAAACAAACA AACATCCACA CACACACACA CACACACACA 1260
CACACACACA CACACACACA CACACACACA AACACACACA CAAACACACG CACATGCACT 1320
GAGAAGATAT ACACACTGAT CAGACATACA CACACACATG CACAGAGAAG AAGATGCACA 1380
CACTAATTAG ACACACATGT GCACTGCGGA CACACACACT CAGACAAACA AACAAACATA 1440
CACAAACACA CACACACAAA CACACACACA TGCACTGAGA AGATATACAC ACTGATCAGA 1500
CACACACATG CACTGAGGAG CAGACACACA CAGATACACA CACACACATG CACTGAGAAA 1560
AGGATACATA CAGATACAGA TACACACACA CACACACACA CACACACTGA GAAGAAGATA 1620
CACACACAGA TCCACACACA CATGCACTGT CTAGGCTTTT CCCACAGGGC TGTGTAGTTT 1680
TGTATTTAGT TTGTCCTCAA TAATAAAATG CTTGATTTGA AAGCTGCATG ACATGTTTTC 1740
TGCTGTTATC TTTGACTCAT ATGTGAATAT GGTGGATGAT CGGAAACATT AAAGTGGGAC 1800
AAACATGCAG CAAAATAAGA AACCAGTAAA GGGGACTTCT CCACAGCACT GTACTGCAGA 1860
AAAAGACTTG TACAGTGTGA AAGTCAGAGT CTCCACGGGG ATCTCTTC 1908