EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02953 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:50277011-50278693 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr13:50277271-50277283AAACATATGCTG+6.04
ESR1MA0112.3chr13:50277673-50277690TGGGTCAAAACGACCTG+6.14
GFI1MA0038.2chr13:50277802-50277814CAAATCACTGCA+7.22
ZNF24MA1124.1chr13:50277347-50277360AAGTGAATGAATG-6.21
Enhancer Sequence
GGGGAGGGGG TAGATGTTAA AAAATACATT GTATTGGGTA ATAGATAGCA TAAATAATAC 60
TTGGTACAAC TACTGTTTTT GCGTTGCTGT GAGGGTTGGG TTTAGGGTTT GAGTGGGTGC 120
AGACGTTAAT AAAATACAAT AAATGGGAAA TTTAATAAAT AACATACATA ATTCTTGTTA 180
ACTTCAGGCT ACAACCGTAT CTGATCTAGC AACCATGTTT CCTAGTGTTG GGTTGCAGTT 240
GGAAGGGCAT CCACTGCATA AAACATATGC TGGATAGGTT GGTGGTTCAT TCCACTGTGG 300
AGACCCCTGA TTAATAAAGG GACTAAGCCG TAAAAAAAGT GAATGAATGA TTTATACTTT 360
TAATCATTTT GACCAGCTGA GGAGGCATTC AGAGAGAGGA AATACACACA TGAAGTGCTG 420
ATTACAGAAA GAAACTATGA AGACTGAAAT TAATGGCACA TTTAAAAATA GTATTGAAAT 480
TAAAACTTGT CGTGATCTGT GTTTCAGACG TGTCTAATGC GGTGATAATT GTTCAGGATG 540
TGTGATTTTA ATCGACTAAA CACCTTTCAG AGGTGATCTC TGAGACATTT TTGAAGCAGA 600
CGAACATCAA GACTCATTGT TTAAATAACA GGAGCAATCG AGCACAGAGA AAATCTGATT 660
CCTGGGTCAA AACGACCTGA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 720
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACTCCCA TGAGAAACAG ACCCTGAACA 780
ACCAGAAGAA ACAAATCACT GCAGGATATG ATAACGCATA AAAAGCCTGA TTACAGTAGC 840
CTTCTGACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACATAC ACACACAATT ATACACTTAC 900
ATACCTATAC ACACACACAC ACACAATTAT ACACTTACAT ACCCACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC AATTATACAC TTACATACCC ACACACACAC ACACACACAC ATAATTATAC 1020
ACTTACATAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1080
AAATATACAC TTACATATAT ATTCACACAC ACACACACAC GCAATTAGAC ACTTTCACAT 1140
GTGCACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT 1200
ATATACGTAC ACATAATTAG ACAGACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1260
ACACAAATAG ACACTTACAC ACGTGCACAC ACACAATTAG ACACTTTCAC ATGTGCACAC 1320
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC TTNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1380
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1440
NNNNNNNNNN NNACACACAA TTAGATACTT TCACAGTTAC ACATGTGCAC ACACACACAT 1500
TTATATGCTT ACACACAATT AGACACAGAC ACACACACAC ACACACCCGG TTATAATTAG 1560
ACACTTGCAC ACTTGCACAC GTGCACACAC ACACACACAA ACACAGTAGT GGAGATTTGA 1620
CTTTGTTTGC TATATTGTGT TATGTTTAGA TGATCTGAAT AGTGTGATCT CTCCTGACCC 1680
CG 1682