EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02918 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:48170556-48172675 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr13:48171792-48171812TCTGGGTGGTTGTTATGTGG-6.18
RREB1MA0073.1chr13:48170951-48170971CCCCCACACACACACACACA+6.95
SPICMA0687.1chr13:48172599-48172613AAACAGAGGAAGTA+6.07
Enhancer Sequence
GGTCCTTTAG GGTACAATTT TGTACCCAAA TGGGTACAAA CGTTCAGATT TAAATTTAAA 60
CATATTTGTA TGTTCCTATG AGCAGCGACA GTGTGTGTGT TTGTGTGTGT GTGTTGTGTT 120
CTGGAGGAGC TGTAGCCCCA TTTCGCTGTC TCACCATAAA CACACACTCT CACCACCTCC 180
CCATGACTCC TGGTTGCGTA GAAACACGAG GCCCAGTCTG CCCTGCGGAC ACACACTCCT 240
CGCTTCATTA CACACTGCTC ACTGAGGCGG CGACACCGAG GCGGCACGCG TTTCACACAC 300
GCGCACACAC ACACACACAC GATGCATCAC ACATACAAAT ATAGAAATAT CACACAAACA 360
CACACAATAA ATCACACAAA CAAATATATA AATATCCCCC ACACACACAC ACACAATACA 420
CACACATATA AATAAATATC ACACACCAAC ACACACATAT TGCATCACAC ATACAAATAT 480
ATAAATATCA CACACGCAAA CACACATCAC ACATACATAC ACACACAGAG AATACATCAC 540
ACAAATATAT AATTATCTCT TACACACGCG CACACACACA CACACACACA CACATGTACA 600
ATCACGCATA CAAATGTATA GATATCACAC ACACACCACA CATTACATCA CACAAATATA 660
AATCTCTCTC TCTCTCACAG ACACACACAC ACAAACACTT GCACACACAT ACACACAAGT 720
ATATAGATTT TTGGACACAT ACATAAACAC CCACAAATAT TACACACATT GCACATGCAC 780
ACACACACAC ACACACACAT GCNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 840
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 900
NNATTCTTGT TGGTTGTAAT GTGGTAGCTA AGGTGTTGCT CTGTTGTTAC TTTGGTACTC 960
TGGGTGGTTA TCATGTGGAT TCTAATGTGT TGCTATGTGT TACTTGGGTA TTCTGAGTGG 1020
TTGATATGTG GTCGCTAAGT TGTTGCTATG TTGGGAGTAT TCTGGGTGGT TGCCATGTGG 1080
TGACCGAGGT GTTGCTATGC TATTGTTAGG GTATTCCGGG TGGTTGTTAT GTGGTTGCTA 1140
ATGTGTTGCT ATTTTGTTAC TAAGATATTC TGAGTGGTTG TTATGTGGTT GCTAAGGTGT 1200
TGCTATGCTG TTATAAGGGT ATGGTTGTTA GGGTATTCTG GGTGGTTGTT ATGTGGTTGC 1260
TATGTTTTTA CTATTGTATT CTAGGTGACT TGTGTGGTTG CTAAAATGTT GCTATGCTGA 1320
TATTAAGGTA TTTTGGAGAA GATATGCAAA CTATAAAAGC AGCTGAAGTC TAAATTATTA 1380
GTCCTCTTGT GAGTTTTCTT CTTCAGATAT TTCCCAAATG ATGTTGAACA GATTCAGGAA 1440
TTTTTCACAG TAATTCCTAT AATATTTTTT CTTCTGGAGA AAGTCTTATT TGTTTTATTT 1500
CGGCCACAAT TAAAGCAGTT TTATATTTTA TTAAAACCAT TTTAAGGTCA TTGTTATTAA 1560
CCCCTTAAGC AATATTTGTT TTGGATTGTC TACTGGGTAA ACCACGGTTA TACAATGACT 1620
TGCCTAATTA CCCTAACGTT ACCCTAAATA ACCTAATTAA GCCTTCAAAT GTCACTGTAA 1680
GCTGAACACT AATATCTAGT CAAACATTAT GTTGTCACAG AAGGAGAGAC GTTACGGATC 1740
AACAAAGTTT AAGGATGGCA TTGAATAGTG AAGGCAGATT GGTTTAGCTT GGTGTGAGGA 1800
TCATGGATCG GGCTGTGGCA GATAGAGGGG AGCTCAGACT CACACACAGG GACCAGACTA 1860
AGAACAAATA GGGCAACAAG GAATGATGGA TACTAGGATG AACTCTGAGG ACACTGGAGG 1920
TAGGATTGAG TGTCTTGAGA CGGGCCAGAG ACTGGGAGTG GAATTGACAC ACACACACAC 1980
ACTGAGGAAA GGATGAGGAC TAGACGTCAA AGCAGTAGAT GACAACACTA GAAGTGACAC 2040
AGGAAACAGA GGAAGTAAAT AACATTTAGA ACTGAGGTAA ATACGCTGAC CATGTAGGAA 2100
GAATCGGTCC TTCTGGATG 2119