EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02755 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:33636454-33637833 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr13:33637073-33637085TGTTTACTTTGT+6.18
GSC2MA0891.1chr13:33636574-33636584CCTAATCCGC+6.02
RREB1MA0073.1chr13:33636697-33636717TGGGGGTGGGAGTTTTGGGA-6.08
Sox3MA0514.1chr13:33637417-33637427AAAACAAAGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr13:33637771-33637783ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
GGGGAGTTAA AGACGATGAG CTCATAAAGG ATTAAACTTT AGTTTATTTG ATTGTCTTTT 60
CCTTGTGGGG TTCGGAGACT GTTAGGACTC CAGGAGAACG GCACAGAGAG GGGCCTGGCC 120
CCTAATCCGC GGATATTGAG CGGGATTCCT GGGATGCGCC TGCTTTCCGC TCCTTTGCTT 180
CCTGAGGTGT GACGGGAGAT GCTGGGGAGA TCGAGGACTG ATGATTTTTC TCTCTTTTTT 240
TTGTGGGGGT GGGAGTTTTG GGAGGATTCC TCAGTGTCTT TTGTTGAGAC AAGTTTTCAC 300
AGTTTTGGGG GTGAGTAGTT GAGAATTGTG TGTCCAGTGG AGTGCGTCTG AAGAAGGGAA 360
GGGGGACGGG GGGGCCTCAG AGGATTAGTC TCTCAGAGAA TAATCACAGG ATCAGTTCAT 420
ACTGCTCAGG AGGAGGCCAC ACTGAATGCC TAGACATTCT AGAAAGAGAA ATAGAGGGAG 480
ACTGTGTGAT GTAATGTGTC TGCAGTGCTT TATAAAGATT GTATTTATAT TATACTGTGT 540
TTAGGGAGGT TATTTAAAAA TTGAAGAATT AATAGGTGTT TAACTTTTAA ACAGCATTTT 600
AAAATGGGCA GTGAGACACT GTTTACTTTG TTGCATAACC CTGTTATTAA CTGCAAAACA 660
TACCGAAGTT ATTAATTGAT ATATAATTCC TGTTCTAGTT TTATAAAATT ATTTTACATA 720
GAGTTTTTTT TGTGGCCTCC TTATAAATTC TATATTTTTC TAGAACAAAA CATTGTAACT 780
TTATACCTTA CGTTAAAGCA AAATGCTGTT AATATCAATA AAAAAACAAA GTGCAATAAA 840
ATGAAAAAAA AAACTTAACA AACCAAATGA AATCTTAAAC CAAAAACAAT ATCAGAAGCT 900
AAAAACAGCA GCAAAACAAA AAAGCACAGA TCAGCAACAA AAATAAATAA ATAAATAAAT 960
GAAAAAACAA AGGCAAGCTA CAAAAAATAA AAATGAAAAC CCTGAAACAT TAAACCCAAG 1020
CATAGTAACT AAAAAAAGCA CAACAGAACA GTAGAACAAT GAGTATTAGA TACACGAATA 1080
ACCCTCTTTT TATATCATAA CTAAACAGGT TTGAACTCGC ATGAACAAAC CATTAACCCT 1140
TTTTACATTT GTTTTTTAGT TAACTTGTGT CCCTGACACC ACTCAAAGGG ATCTCGGTTT 1200
TCAGTTTAAA TGACAACCTT GGAACAAAAG GTCAATACTT GTGAACACAT ACTTGTGAAA 1260
ATGGGCATAA AAATATTTCA AATTTTAAGT TTGAAAATGT ATTTTTATAT ATACACTATT 1320
AAAAAAAAAC TAAACAAAAA AGAAACAAAA ACATTTTTAA GATATAAAAA GAAAACTTT 1379