EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02720 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:29997841-29998537 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr13:29998394-29998411AGGTCATACAGATGTCA+6.46
Rarb(var.2)MA0858.1chr13:29998394-29998411AGGTCATACAGATGTCA+6.82
Enhancer Sequence
GATATGAAAA TGCATGCAAA ACACACACAC ACGCACACTG TGGCTTCTCA AAATGCGCAT 60
GTCTGTGTGT TTCCTCTCCT TATTTTGGGC TCAGATACAT ACATTCCCAG CTGTGATGAG 120
GACGGCTTTT ACAGGAGACT GCAGTGTGAC AAGAGCAGAG GGGAGTGTTG GTGTGTGGAC 180
CAGCATGGAG GAGAGCTAAT GGGCTCCAGA ATCCATGGCA ACCCCGACTG TGGTGAGCAC 240
GAGCTCAACT CACACACACA CACATATGCC CGAATACACA CTAACACACA CAAAGACAAA 300
CACACATACA CAGACGTAGG TTGGCATTTG TGATTTATGA GGACTCTCCA TAGGTGTAAT 360
AAATTTTATA CTATAAAAAA ACACCTATTA TATGGCCTCA CCCTACCCCT GAAGACATAC 420
CTCTTAGCAA ATATGTGGCG AAATGAGAAA TGTAATGTGA AAAACTATTA AATGTGATTT 480
TAAACAGTTT TAAATTTCGA GGACACAAGG CATGTCCTCG TTAATCACCT ACTGTAAACA 540
TTGTGAAACC TATAGGTCAT ACAGATGTCA TTATACAAAT GTGTGTCCTC ATAAACAAAC 600
ACACACGCAT TGGGTTTCTG TGAATTTCAC AGACTTATAC TGACCAATCT ATAATTTCTT 660
CGGTGAACCC AACCTTACCC CTAAACCTAC CCCTAC 696