EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02687 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:28083720-28084586 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr13:28084177-28084190GAATTAATTATCC+6.32
NFYAMA0060.3chr13:28083803-28083814TCTGATTGGTT-6.62
Nr2f6MA0677.1chr13:28083929-28083943TGACCTTTCACCTA-6.12
Enhancer Sequence
TACAATGATC TCTTCTCAAT GTCAAAATCC TGCAATGACC TCTTGAAAAA GAACGACCTC 60
ATTCATCCTA TGAGGCAGTG GAGTCTGATT GGTTGCTGCG TTAACAATCA CCAGGGCAAC 120
AGGAGTGACA GCACAAAATA TTTAGACCAT GATTCATTCC ACACATCCCA AATTCCTAAC 180
CTCCTAATAA AAAGCAGTGT TAAAATGCAT GACCTTTCAC CTAAAACAGG CTTAAAAGAA 240
CAAGCTCAGC TGCCTGTGCG AGTCCACTGC CCTGATTCCT AATTAACCAT GTAATCCTGT 300
ACACAACTGT TTCGAACATA TACAAACGAT GCATATTTGC GTTATCAGTT CAATGTCACG 360
TCCGTCTAAG CCTGTCAGAG ACAAATTAAT ATGAGGATGA TGGATCAGAC TGAAGGAAGA 420
GTGGATGCTG AAATACAGAC AAGTAATTAC CCATCAGGAA TTAATTATCC ATCCAGACGA 480
CAATTAATAT GCGAAGGGGA GATGCAAGAG TCCCTTTTGA TTGCTTAAAA ACTCATAAAT 540
CTTTCAAGCC ACACTGCTCT TTATAGCACA ACACAGAGAG AGACACACAG ATATGGTCAC 600
ACACACACAC ACACACACAC ACACAAATGT ACACCTGCAA TAGGAGTGAA GGTTATTTGA 660
GCAATCACTC ACTACATCAG ATAAACAGAT CATATGCCTT CAGGAAGGTT TTATTTTTAA 720
TGCTAGTTCA GCTTTTTACT TGCCTGACCA CAAATATGAA AAAAACATGT TGCTCATTAT 780
TTTCTTTAAC ACTTTAAGGC TTGTACATTT AATAAAACCT CACTTACAAT GAGTGGATTT 840
TTTTTTACTT CGTATATCCA GTTAAA 866