EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02637 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:23525218-23526357 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr13:23526301-23526317CACTAAGCAAACAAAC+6.77
FOXE1MA1487.1chr13:23526301-23526316CACTAAGCAAACAAA+6.47
HOXA13MA0650.2chr13:23525457-23525468GTTTTATGGGG-6.02
SOX21MA0866.1chr13:23525542-23525557AACAAGGCCATTGTT-6.28
SOX8MA0868.2chr13:23525549-23525559CCATTGTTCT-6.02
Enhancer Sequence
TCTATAATTA TTATAAAGGG TTATGGGGGG TGGGGTGGTG CTGGGGTAAT TGTAAAATTG 60
TCATTTAAAC TGTAATTTTT CTTTGTGGAT AAAAATCTGA AATAAAAAAA AGCTCCATAA 120
TCGCCCAGCC CAGGCCTACC TGGAATACAA AAACTTTTAA GCTAGTACTT CAATACAACT 180
TTGATTCATC CACTCTTTTC TTAAAGGTTT CTTCTTCCCT TTAGATTTCA ATGGCGTCCG 240
TTTTATGGGG CAGAAAATCA TCTTTAGATC ATGAGACAAT AACCGCTGCC TGTTGTATGT 300
TTGCCACGGT CCCTCTATCC TTCCAACAAG GCCATTGTTC TCTCCACTGC CAGTCAGAAT 360
GTGTGTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 420
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGA GAGAGCATTT TGGAGAGCAC ACATGCTTGA 480
GATTCCTTAA CGTTTCACTT CATGTGCCTG AAATTGCAAA AGCAAGTTTT TTTTGGAGTG 540
TGGCAAAGTG CCGAGTTTCA CAGGGACTGC TGGCTACAGT TCCGCAATAT TCTTTACCCC 600
CAATCAGGGG AAGCTCCCTG TCTTGGAGAG AAAACAGCGG CCATTGAGGA GATTAAAAAT 660
AATGAAAATA AGCCTTTCAG GCCTAGGAGT CGGTGCATTC TCGAGTTGGC AGTCACCTAG 720
CAACCAGTGC TTGACCATTC CATTGTGCAA ACTTATGTTA AGCTTTTGCC CCCTCGTTAG 780
CGACATTCCT TTGAGTGAGG TATTAAAAGA TTAGGCCACA AAAACATCAT TTCATTCACT 840
ATTTGCTATA TCTTAAAGGT AATCATTGAT CAGATAAGCA AGAGTGGGCA CAAAGCAAAT 900
CTGGTTTCAT TTCTTATTTT TGAGAGACTA GTATTTGACT TTGCTGTTCG GGCCTCTCTA 960
AAAATGTACC CTCCACCTTT AACCTGCTAA ACAATGTAGT GCAACCTGAA TGGGCAAGGA 1020
GTCCTCCTTA GGAACGGAGC AGTAAGGGTC CTGGTTCGTG ATGGGTGGGT GTCCTGAGTG 1080
CAGCACTAAG CAAACAAACG TTACTTTTTC AATTAAGGTC AGCAAGCTTC TAGTGTTGT 1139