EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02616 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:21069432-21070566 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr13:21069840-21069852GTTTGTTTGTTT+6.32
PBX2MA1113.1chr13:21070284-21070296TTGATTGACAGG+6.44
PBX3MA1114.1chr13:21070282-21070299AATTGATTGACAGGCGC+6.35
ZNF384MA1125.1chr13:21069976-21069988TTTTTTTTTAGT-6.32
Enhancer Sequence
TTTCTTGCTC GTGAGGTGTT ATTTTCACTT TGTGCTACAG ATAAATTGGC AGACCGCCCA 60
TGAGGAGAGA AAAATGTTTA ATTGATGTTT TGATTTGTAT GTGCATGTTC CCAATAAGAG 120
AAGCGCTCTG TGTATCTGGC AATTACCATC CTTTCCTGAT ATGCAGCGAG CTTCATATTG 180
GCATTTTATC TCCCTAGATT CTTTGATTGA GCAAAAGGCA GCGCTTGCAT ATTTATACAT 240
TTGGCAGAAA ATTAGAAGTT TGAGTGGAGC TTTAGTTGTA GCACTCTTCA AAATAAACGA 300
CATATGAGAT GTGCTACATT CTTTGAAAAT GATTTGATTG GCTTTTGTTT TCTGTGGGTA 360
TTGTTTGTTA ACTAATGATT TGGTGTTGTT TTGTTTTTAA TTTGCTTCGT TTGTTTGTTT 420
TTGTTTGTTT TTCGTTTGGT TGGTGTGGCT TTTTTGTTTG ATTTGGTATT GTTTGGTGTG 480
GTGTTTGTTT TATTTTATTT GCCATTTTAT GCGTTTGTTT CTTTATTTAG CGTATATTTT 540
TTTATTTTTT TTTAGTTTTC ATGGGTTTGA TTTTACATTA GTGTTAATTT GATATTGCTT 600
GGTATGTGTA GTGTTTTTTC ATTTGTTTTT TTAGTTTGGT TTTTGTTTGA ATTTAAAGGA 660
CATTTATAAG GAAAATCAAC TTTGTTTGGA TAGAACTGTG TGAAGGTATA GTGTGTCCAC 720
AGTCATATTG GAGTAATTTA AACACAACAA GTCTGTTTTT TTATTTCCTG ACGTTAAAAT 780
AGAACCCAAA TCCCAGTGAT GTTGAGGCCC ACCGCAACGT GATGTGGAGT GCAGTTTTCC 840
CTGCCCACTG AATTGATTGA CAGGCGCCAT GTTTATTTAA TACAGTTTTT TAAAATTGTT 900
TTGCCATAAA TTTCAGAACA CTGATGTCAG TTTTCAAAAC TCTTGACACA AAACTTTAAA 960
CACTCACTAC TTTTAGCACA GTCTCTCCAG TGTTCAAAAC TCTACATGAT GCATTAATTT 1020
CCTTAAAGAA GTCTTACAGG ATCATTGGTT CATATAAGGC TTTTATCATA CAAATAATAC 1080
TACAGAAACA CAACTTTAGA TCACCAGCAC ACAAGAGACA CATTGTTACA ATAA 1134