EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02559 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:16239117-16240119 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr13:16240108-16240119TATTGTTTATT+6.62
Nkx3-2MA0122.3chr13:16239514-16239527TTTAAGTGGTATT-6.22
TCFL5MA0632.2chr13:16239316-16239326GTGCGCGTGA-6.02
Enhancer Sequence
AGGGGAGATG CACCTGCGTG GCATAGCGCT ATGTGAGGTA GGGGAGGTGC GTGGCATGGC 60
ACAGTGCGAG AGAGGAGACA TGCAAGCGTG TGTGGCGCGG CATATTGCGA GGTAGGGGAG 120
GCGTGCGTGT GTGGCGCAGC ACGGTGCGAG GTAGGGAGAG GCTCACGTGT ATGCTGCAGC 180
ACAGTGTGAG GTAGAGGAGG TGCGCGTGAA TGGTGCAGCA CGGTGTGAGG TAGAAGAGGT 240
GTGCGTGCAT GGCCTAGCAT GGTGTCAGGT TAAGGAGATG TGTGTGTGGC CTGGTGAAAG 300
AGAAGAGACT CTTCTGAGCA TAGCATAGTG AGGGAGAAGA ATAGGATGGT GAGGGGGAAG 360
ATAGACACTC AAAGTATGGC AAGAGAAGTG AGGCATGTTT AAGTGGTATT GTATACCAAG 420
GGAGGAGAGA TGTGAGTGGC ATAGTATGAA GAGGGAGGAG AGACACGTTC TTGCCTGGCA 480
TATTAGGGCG AGGGAGCAGA GATGTGCATG AGTGGCATAG TATGGTGAGG GAGGTGAAAT 540
GCGTGAGTAA CAGTATGGCG AATGAGCTGA GAGTGGCATA GTATGGCAAG GAAGGTGAGT 600
CTAGTAAGAC TGGCATAGTA TGGCAAGGAA AGCAAGACGA GTGCCATAGT ATGGTGTAGG 660
AAGGAAGACA CACATGAGTA GCAAAGTAAG TTATCGTGTG CATGAGTAGC ATAAAATGGC 720
AAGGAAGGAA AGATGCACAA ATTGCATAGT TTGGTGAGAG ATGAGGCTCA AGATAAGTAT 780
ACTATGGTGA GGGAGGTGAG ATTTGTGTGC GAGTAAATGA AAATACTCCA ACTAATTTAA 840
AAGCCCACAA CTTTGAAAAT TTGTCTGCTT AGGAGTTTGT TTGGACAGTC TTTCACTGAC 900
ACTCAACTCA AGATGCCCTA TGTCACTGCT AACTGTAAAA AGCTATGTCT CTCCCACTCA 960
TTGAGCAGCG AAACAATGTT GATCGTTTTG TTATTGTTTA TT 1002