EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02526 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:13236021-13237093 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr13:13236248-13236263GGGGGTGAAAGGTCG+6.21
PKNOX1MA0782.1chr13:13236357-13236369TGGCAGGTGTCA+6.02
PKNOX2MA0783.1chr13:13236357-13236369TGGCAGGTGTCA+6.27
RREB1MA0073.1chr13:13236446-13236466CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr13:13236444-13236464CCCCCCCCCACACACACACA+6.38
RREB1MA0073.1chr13:13236448-13236468CCCCCACACACACACACACA+6.95
RXRBMA0855.1chr13:13236249-13236263GGGGTGAAAGGTCG+6.06
ZNF143MA0088.2chr13:13236991-13237007CAATGGATTGTGGGTC-6.35
ZNF740MA0753.2chr13:13236442-13236455CACCCCCCCCCAC+6.09
Enhancer Sequence
ACCCGTCACA GAACAATAGG TGTGATTGAA TTGAACGGCT GGGATTTGAG AGGTGACACT 60
ATAAAAATCG CAATAGCGCA GTGTAATAGT GATTTACAGT CCGGAAGGCA AATGTCTACA 120
CAAACATGCA TGTTACACGA AGCCACTCAC ACACAGGGAG AAGCGAATTT TCTCACTTTT 180
TCTCACACGT ACTGTGAAGA AGTGTCTCAT TGTTCTTTCC AGTGCCCGGG GGTGAAAGGT 240
CGAGTGGAGT AAGTACAGTT ATCAATCAAG CCCTAAGCAC CAAGACTCTC TATGCTGTTC 300
TGTTCTGCTT GCTGCAGGGA TTTTACAGAC GTTCACTGGC AGGTGTCAAA TACCAGCAGT 360
GCGAAATAAT TACTGTCCCG CTGAATTCAG CTCCACTTAC TGGCTTTCCA CACCTCCGGT 420
ACACCCCCCC CCACACACAC ACACACACAA CTCTCACTCA TCCACTCATT CCGGTTGTGC 480
CGCACTTAAA CAGCTCTTCT ACCCAAGCCT TACTGAAGTG GATGGTCTCT CAAGTAAAGA 540
GCTTCTCTGT CAGTATCTGC GTGCATGTGT GTGTGAGTGT GTGCATGTTT CTGAAATGTG 600
CATATACCTG TGTGTGTTGA GTCTCTGAGG GAGTGTCTTA TTACCGAAGC TGTTTTAGTG 660
AAGCAGCGTG TGTGTGTGTG GCTCGGTGAG TGTGCGTGTG TGTGCTGTGG ATTAATGTCT 720
CTTTGGGAGT ATTGCATGAC CAAGGCCGTA ACATACAGTA GCACATGTGT CTGCCAGTTA 780
CTCCTGAAAT ACTGCGTCCC AATGGAGAAC AGTGTGTGTG TTTAGACACA ATTAGTAGGC 840
CTTCGTGGGA GCTAAAGTTT GTGAATAATG TGAATGGGAA ATCAATAAAG CTGTTGTATT 900
ATTCATGTTG AGTTTGTGTG TTTGTGGTTC TGCGCATGTG GTGCGGTGAC AAGAGTGGGA 960
CTTTTTTTAA CAATGGATTG TGGGTCTAGA CATGTAAAAA ATGAGTTGGA AAATGGTGAT 1020
TTTTTTGTAA ATAGTTATTC TGAAGGCATT TTCTTTTAAA TACCATGCGT GT 1072