EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02442 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:5514355-5515727 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr13:5514437-5514451CTGACCTAATTAAC-6.05
RORCMA1151.1chr13:5514438-5514450TGACCTAATTAA-6.14
RREB1MA0073.1chr13:5514587-5514607CCACCAACCACCAACTACAA+6.6
ZNF384MA1125.1chr13:5514880-5514892TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr13:5514882-5514894TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TATTAGCCCA CTTAACCAAT TTTTTATTCA AGTTTCTACA GAACAAGCCA TCGTCACACA 60
ATTATATGCC TAATTACCCT TACTGACCTA ATTAACCTAG TTATGGTGGC TTGAGAAAGC 120
CAACATACTG TTATACAACT AAACTAAAAC TTAGTATTCT TCTGCCTGCT TCTTCTTCTT 180
GGACTTTTAA GATTTTAAAA ACGCATTTCC TCCTAGACTA TTCATAAAAC AACCACCAAC 240
CACCAACTAC AAACTATACT GAATTAAGTT GCTATATCTT TTCCAACTGA TCCAACTTAC 300
AATTTTTCGA AAACTGCCCT GGAAAATTTG AAAAAGTCCC ATTGACTTAA CATTTGACTA 360
AACTTTGCGA CTTCATAAAT TTCCGCCAGA CAGTCATACA GACTTAAAAT AGGGCTAATT 420
TAACTTAGAC TACCAATCTG CCAAAAAATT GATGACCTTT CAACTTACTA GCTACACCCT 480
AGCAACAACT TACAGCACCC TAGCAACTGT CCCATAGACT TCCATTGTAA AAAAAAAAAC 540
TGCCATTGAC TTTACATTGG TCATAGTAAC AACACAACAA TTCTTTCTAA CAACGTACTA 600
ATCCATACTA GTTTATGTTA GCAACTGCCT AGCAACCACT CAGAAACCAT TTAGCAACCA 660
CTTAAAACAT CCTAGAAACC ACCTAGCAAC ACCTTAATAA CCACATAGAA CACCCTAGAA 720
ACCGCCTAGC AACACTTTAG CAACTATTTA GAACACCCTA GCAACCAGTC AGAACACCTT 780
AGCAACTGCC TAGCAATGCA TTACCAACCA CCTAGAACAC TCTAGCAACT GCCTAGCAAC 840
ACCTTAGTAA CCACTCACAA CGCCTTAGCA ACCACCTAGT AACCATTCAG AACACCCTAG 900
CATCCTCCTA GCAACAACTT AGCAACCACC TAGAACACTC TAGCAACCAC CTAGCAATGC 960
CTTAGCAACC ACTTAGAACA AACTAGCAAC ACCCTACCAA ACGCCTAGAA ACCCCTTAGA 1020
ACACCCTATC AACCGCCTAG CAAAAAACAT GCCAGTCCAT ACACGTTCTC TCCGTGCTCA 1080
CGAGGGTTTC CCCCGGGTTC CCCGGTTACC TCCCACCATC AAAATACATG CATCTTAAGT 1140
TAATTGACTA ATCCAAATCA GCACCATAGA CATGCTCCTA GTAAGCAATT GCCTCTTATG 1200
AGCAGGGCCA GATGGAATCT GTGGACGTGT TTTGCTATTT CTGCAGAGAA TTTTGGTAAA 1260
AATCTGCGGA TTTCTGTGGA ATTATTTTGG GAGTATCCAG CGGAGTTTCA TAACCAAAAC 1320
CTTAATATAT GAAATAAAAG TAATAAATTA CTGAATAAAA ACTGAATAAA TT 1372