EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02417 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr13:4042080-4043440 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA+6.21
RFX1MA0509.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA-6.21
RFX2MA0600.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA-6.52
RFX2MA0600.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA+6.54
RFX3MA0798.1chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA-6.35
RFX3MA0798.1chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA+6.38
RFX5MA0510.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA-6.86
RFX5MA0510.2chr13:4043076-4043092TGTTGCTATAGTAACA+6.92
Enhancer Sequence
TTTGTTCTGT AGACTATCGA AAGAAAATAT TGCTTAAAGG GGCAAATAAT ATTGTCCTTA 60
AAATGGTGTT TAAAAAACTT AAAACTGCTT TTATTCTTGC CAAAATAAAA CAAATAAGAC 120
TTTCTCCAGA AGAAAAAATA TTATCAGACA TACTGTGAAA ATTTCCTTGC TCTGATAAAC 180
ATCTTTTGGC AAATATAAAA TATATATATA TATAAAATGG AGTTCATAAA TACCATCACT 240
TTCTAATAAA ACTGAGTCTA TAATCTACTT TCTCCAGCAC TCGCTGAACT GAGCAAAACC 300
TTATGTTATT ATATAGTTAT ATGGGTATTT AAGGTAAGAA AGACAGACAG ACAGACAGAC 360
AGACAGACAG ATCAATAGAC AGACAGACAG AAAGGTAGAC AGACAGATCG ATAGACAGAC 420
AAAAAAGTAG ACAAACAGAC ACAGATAGAT AGATAGATAG ATAGACAGAC AGACAGACAG 480
ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGAAAGGTAG 540
ACAGACACAG ATAGATAGAT AGATAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 600
AGACAGACAG ACAGACAGAC AAATAGATAG ACAGACAGAA AGGTAGACAG AAAGGTAGAC 660
AGACAGACAG ACAGATAGAC AGACAGAAAG GTAGACAGAA AGGTAGACAG ACAGATAGAT 720
AGACATACAG AAAGGTTGAC AGACAGACAG ACAGGTAGAC AGAAAGGTAG ACAGACAGAC 780
AGACAGACAG ACAGACAGAA AGGTAGACAG AAAGGTAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAG 840
AGAATGATTC ACATCATGGA CTGAAACATG CATTTGAATG ATGTCTTAAG CAGAGCACTA 900
AACTCATATG CTGTAAATAA GGAAGCTCCA GCAGGCAATC TTTTAAACTA GTTAATCTCG 960
CTCCGCTGTC TACACACAGA AGGCATCCTC TCTCACTGTT GCTATAGTAA CAGTGACCAC 1020
CACGGACACG CAAACCAGGA TTGTACTGTG GTATTCATCC ACTTTGCTTA AAATGCGAGT 1080
GTCGTGTATG TGTGTGCGTG TGTGTGTGTG CGTGATAGAT GCTGTGTAAA AGGGATGAGT 1140
TGTTATTTAA AGCCCATCTA ACGCGGCCCT TTGAAGATGC TTTTATCCTC CACTTCACGC 1200
CAGTGTTTTA AAGTGGATTC AATCTTCATA GGAAAAGCAC AGATATCAAA GGTGTAGCAT 1260
TAACATTGGC TCAGTGTGTT GAGTCCATTT TCTCGGGAGG ATGAATATAC CCATCATTCA 1320
AGCTGTTCTG CTCTGAGCTC TGACTGTTAA ACACCCACTT 1360