EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02339 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:48522782-48524526 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr12:48523610-48523625TTGACCTTTCGACCT-6.23
NFYAMA0060.3chr12:48524477-48524488AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr12:48524472-48524487CAATCAGCCAATCAG+6.94
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:48523611-48523626TGACCTTTCGACCTT-6.71
ONECUT1MA0679.1chr12:48524183-48524197AATAAATCAATATT+6.12
ONECUT2MA0756.1chr12:48524183-48524197AATAAATCAATATT+6.16
ONECUT3MA0757.1chr12:48524183-48524197AATAAATCAATATT+6.23
RREB1MA0073.1chr12:48523176-48523196TGTGTGTGTGTGTTTTGTGG-7.29
RREB1MA0073.1chr12:48523270-48523290TGTGTGTGTGTGTTTTGTGG-7.29
RarbMA0857.1chr12:48523603-48523619AGTCCTTTTGACCTTT-6.16
RarbMA0857.1chr12:48523611-48523627TGACCTTTCGACCTTG-7.48
RargMA0859.1chr12:48523610-48523626TTGACCTTTCGACCTT-7.24
ZNF24MA1124.1chr12:48523894-48523907CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr12:48523874-48523887CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:48523878-48523891CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:48523882-48523895CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:48523886-48523899CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:48523890-48523903CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr12:48522850-48522862TTTTTTTTTATC-6.02
ZNF384MA1125.1chr12:48522849-48522861TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr12:48522848-48522860TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
AGATTTAAGT ACAGCAGTTT TCTTTTTACT TTTTAAGAAC TTTTAAAAAC ACATTTTAAC 60
TAAAACTTTT TTTTTTTATC TGCAAGCACA GTTAATGTTC AGACTATTTC AAATGTTTAA 120
AGTGACTGAC AATAATACAT ATTCTTAATA ATAGGATTTA ATCTGCATCG TTTTAAAACT 180
GTGCACACCT GTAGCTGCTT AATTAGGCTT ACGACGCTAT TTTTTAATAC TGGTTAAAAA 240
ATAGCGTCGT AAGGTGGTAC TTGGAGAGAC GATTTATTTC TAAGGTGGTA CTTGGTGAAA 300
AAAGTTTGAG AACCACTGCT TTAGTGAATG TTGTGTCTGG AGATTCAGAT CTTATAAAGC 360
CGTTTAAGGT TACATGGATT ACTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTTT GTGGTTAATC 420
TTGTGTTTTC TGTATTGCGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAT GTGTGTGTAT 480
GTATTGTGTG TGTGTGTGTG TTTTGTGGTT AATCTTGTGT TTTCTGTATT GCGTGTGTGT 540
ATGGTGTGTG TGTGTGTGTG TATGTATTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGA GGAACCCGTA 600
TTTCCAGTTG AACAGTTGTT TGTATTGTCA ATTGAGTTAA AAGGATCTTG ACAAAGTTGA 660
CACACACTCA TACTGCTACA CACACATACT TGCATAACAT TACTATTGTG TGTGTGTGTG 720
TGTGTGTGTT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTACC TTCTATTCTT TACACACTGT 780
GAGTATTTAT TACCAAATGT TCCCACCAGT ATAGTAATAC CAGTCCTTTT GACCTTTCGA 840
CCTTGTGGTT TGATCTTTTT TCGGTCCCCA TGAGGAATAG ATACCTGTAC AGAGGTTTGC 900
GTGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGATAGAGT 960
ATGTGTTTGA ATGTGTGTAA GAGAGAGACA GAGCATGTGT TTGTGTTTTT GTTGTGTGTG 1020
TGTGTGTGTG AGTGTGAGTA ATAGCTATGA TGGTCATAAC AGATTATAAC AGATCAAACA 1080
CAGAACCCTT ATCATTCATT CATTCATTCA TTCATTCATT CATTTTCTTT TCAACTTAGT 1140
CTCTTTATTC ATCAGGGGTC GCCACAGCGG AATGAACCAC CAACTATTCC AGCAAATGTT 1200
TTACTCAGCG GATGCCCTTC CAGCTGCAAC CCAGTACTGG GAAACACCCA TATATAGTCA 1260
TTCACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACGCACT ACGGCCAATT 1320
TAGTTGATCA GTTCCCCTAT AGCGCATGTG TTTGGACTGT GGGGGAATAA ACACTCTGAA 1380
TTAATCATCC TCATTCTAAA TAATAAATCA ATATTCTGTT TGTACAGGAT TAAAACTCTT 1440
CTGGTAATCT TAGATTATAA TCCTGGTCCT GCATCACAGG CTGCTCTCAC TCAGGTCCTG 1500
TGGAAGTGTG TGTGTTTCTC AGTATGAGCT GGCTGCTGGT GTGGATTCAT TCATTATTAC 1560
TTATGGTCAG TGCGCCTCCT ACAGGATCAG TAGTGAACTG TGTGTGTGTG TGTGAGTAGG 1620
TTAGTGTAAT TCCAGCAATA CTGCATGTTC CTGGATCAGT ATAACCCGTG TTGATCCTGG 1680
ATCAACATTC CAATCAGCCA ATCAGATGTG AGGGATGAGT TTATAGTTTA GACAGTTGTG 1740
TTCC 1744