EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02335 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:48353907-48354836 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr12:48354421-48354432TTAATTAATAT-6.62
CDX2MA0465.1chr12:48353987-48353998TTTTATTGCTT-6.32
Lhx3MA0135.1chr12:48354489-48354502GATTAATTAATTA-7.34
POU6F1MA0628.1chr12:48354420-48354430ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:48354490-48354500ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:48354420-48354430ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:48354490-48354500ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr12:48354252-48354272CCCCAACACACACACACACA+7.29
Enhancer Sequence
TCTGTTCTGT TATTGTTATT GTGTGTTCCC TCCTCGTGTT CTTCCTACAT ATTCTGCGTT 60
ATTGTATTCC CATTTGCTTA TTTTATTGCT TAATAAATAA GAAAGGGGCT GTAAACTGTA 120
GGAAATGGTT AACAGTTCCT AAAGTAATCC AATCCTCCCC CGAGCGGAGC CGCTCCTCAC 180
ACTTCAGCAC AACAATTGCT CATTGCAAGA GTTTTACTTT TACACCAACA CAAACTGCAT 240
TTCAGAGAAA CACTGTCCAA TCCAGACTAG TTTTCACATT TGCTGACTCT ATTTAATGTG 300
CAAAAGTCGG TTAACTTGGT TAGTCTAATG ATTTAGTGAA CCCTCCCCCA ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACAGAGAA AGAAAGAGAG AGACATTTGG TGGTTTTAGT TTGGTTGAGT 420
GAAAAAGCTT GAGAAAAGCA GGCTTATTAA AGATTTAAAT CAATCTTTAG ATGAAAATAT 480
AAAGTTAAAT ATGATTACTT AAATGCAGCC ATGATTAATT AATATTAAAA TACTCTAATA 540
ATTAGAGTAC ATCTTAAAAC TTTAATTTAG AGGTATTTAT AAGATTAATT AATTACATTT 600
TTTTAAAGTC TGGTAACTTA GTCTAATGAT GTAGGAAAGA CCCTCCCCCA ATAAACACAC 660
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACTT GGTGGTTTTA 720
GTTTGATTGT ATGAAATAAC TTGAGAAAAG CAGGCTTAAA GAATGAAACC ATCCATTTAG 780
ATAAAAATAA GTATGATTAT TTAAATGCAG TCATTATTTT TTAATAGTAA AATACAGTAT 840
GAGAGTTGAG TACATCTTAA ACTTTATTAT AGAAGTATTT ATAAGATTAG ATAATTACAT 900
TTATGTTAAG ATTAAGTATG TTTAAAGTA 929