EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02317 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:47427251-47428514 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:47427951-47427968GTTGATTAATTAATTGA-6.42
ArxMA0874.1chr12:47427951-47427968GTTGATTAATTAATTGA+6.73
HOXA13MA0650.2chr12:47427630-47427641GTTTTATTGGT-6.32
HOXA13MA0650.2chr12:47427758-47427769GTTTTATTGGT-6.32
HOXA13MA0650.2chr12:47427798-47427809GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr12:47427630-47427641GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr12:47427758-47427769GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr12:47427798-47427809GTTTTATTGGT-6.32
NFYBMA0502.1chr12:47427840-47427855TTGATTGGTTCATTT-6.1
NFYBMA0502.1chr12:47428028-47428043CTGATTGGTTGGTCT-6.45
Nr2f6MA0677.1chr12:47428500-47428514TGACCTGTGACCTT-6.47
PBX1MA0070.1chr12:47427339-47427351TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr12:47427411-47427423TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr12:47427471-47427483TTTGATTGATTG-6.18
PBX1MA0070.1chr12:47427511-47427523TTTGATTGATTG-6.18
POU6F1MA0628.1chr12:47427955-47427965ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:47427955-47427965ATTAATTAAT-6.02
RXRBMA0855.1chr12:47428500-47428514TGACCTGTGACCTT-6
RxraMA0512.2chr12:47428500-47428514TGACCTGTGACCTT-6.02
Enhancer Sequence
TTTTAAAAGT GAAACCACCA ATTTATTCAT GTATTTCTTA AAAAAATAAT ATGTAGCTGG 60
TTGTTTTGGA TAAGAACACT TCATGGAATT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG 120
ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTA TTTGATTGAT TGGTTGTTTG 180
ATTGGTTGGT TGGTTAATTC ATTTATTGAT TGATTGGTTA TTTGATTGAT TGGTTGGTTG 240
GTTCACCAAT TGATTGGTTG TTTGATTGAT TGGTTGGTTA ATTGATTGGT TCATTGGTTG 300
GTTGGTTGGT TGGTTTATTT GTATATTGTT TAGTTGGTTG GTTCCTTGGT TGATTGGTTC 360
ATTGATTGTT TGGTTGGTTG TTTTATTGGT TGGTTGGTTG TTTCATTAAT TGATTGATTG 420
ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGGTTGGT TGGTTGGTTG 480
GTTGGTTGGT TGGTTGGTTG GTTGGTTGTT TTATTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTG 540
GTTGGTTGTT TTATTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTG GTTAGTTGGT TGATTGGTTC 600
ATTTGTTGAT TCGTTGGTTT GTTGTTTAAT TGATTAGTTC ATTGGTCAAT TGGTTGGATG 660
GTTGATTCAT TGGTTTGTTC ATTGGGTCAT TGATTGATTG GTTGATTAAT TAATTGACTG 720
GTTGGTTGAT TGATTCGTTG AATGATTCGT TGGTTGGTTG ATCGGTTCAT TGATTGACTG 780
ATTGGTTGGT CTGTTGATTG ATTGGTTGGT TGGTTGGTTC GTAGACAGAC AGACAAACGG 840
ACGGACGGAT GGATGGATGA AGAGCTCATC CTTGTTCTGT TCTCCTGCTG TTGGTTTATT 900
GAGGATGTTT TGATAATGAT TGTCAGAGTT GGACATCGTT ACACTTATTA TTATATGGCT 960
ACTTAAAAAG CAACATCAAG TATTAATACA TATGTCTGAA ATATTAATAT GACTGTGACT 1020
GTGACAGATG GTCTCATAGC TGAGAGTCAA ACTCACACAA ACTGACACAC ACACAGACTC 1080
TCTCTCTCTC TCTGTCTCTC TCACACACAA GCATACGCTG ACACACACAC ACACAAACAT 1140
ACACTTTTAC GAATCTCACA CTCTCACTGA CACAAACACA CTCTTTCTCA ATCACACTCG 1200
CGCACGCGCA CGCACACACA CAAACACCTT AACAAATATC AAGTGTATGT GACCTGTGAC 1260
CTT 1263