EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-02281 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:43818762-43819771 
TF binding sites/motifs
Number: 44             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:43819435-43819452ATTAATTAATTAATTCA-7.27
Arid3bMA0601.1chr12:43819493-43819504ATATTAATTAA+6.62
ArxMA0874.1chr12:43819436-43819453TTAATTAATTAATTCAT-6.04
ArxMA0874.1chr12:43819395-43819412ATTCATTAATTAGTTTA+6.53
ArxMA0874.1chr12:43819512-43819529TTCATTAATTAATGTAT-6.67
ArxMA0874.1chr12:43819435-43819452ATTAATTAATTAATTCA+6.7
ArxMA0874.1chr12:43819511-43819528ATTCATTAATTAATGTA+7.39
Lhx3MA0135.1chr12:43819494-43819507TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr12:43819438-43819451AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr12:43819426-43819439AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr12:43819429-43819442TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:43819433-43819446TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:43819437-43819450TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:43819430-43819443AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:43819434-43819447AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:43819497-43819510TAATTAATTAAAT+6
POU4F1MA0790.1chr12:43819424-43819438TTAAATAATTAATT+6.01
POU4F1MA0790.1chr12:43819562-43819576CTTTAATTATTCAT-6.37
POU4F2MA0683.1chr12:43819424-43819440TTAAATAATTAATTAA+6.25
POU4F2MA0683.1chr12:43819560-43819576TTCTTTAATTATTCAT-6.3
POU4F3MA0791.1chr12:43819424-43819440TTAAATAATTAATTAA+6.3
POU4F3MA0791.1chr12:43819560-43819576TTCTTTAATTATTCAT-6.46
POU6F1MA0628.1chr12:43819431-43819441ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819435-43819445ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819439-43819449ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819495-43819505ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819515-43819525ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819431-43819441ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819435-43819445ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819439-43819449ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819495-43819505ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:43819515-43819525ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr12:43819596-43819609TTTTCATTCATTC+6.15
ZNF24MA1124.1chr12:43819478-43819491CATTCGTTCATTC+6.41
ZNF24MA1124.1chr12:43819446-43819459AATTCATTCATTC+7.22
ZNF24MA1124.1chr12:43819458-43819471CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr12:43819450-43819463CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819454-43819467CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819600-43819613CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819604-43819617CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819608-43819621CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819612-43819625CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819616-43819629CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr12:43819620-43819633CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
ATATAAATGT GAATAAAATC GCCAAAAATA CCTCAGTGTC AGTTCAACTG GATCAGAGCA 60
TGAATTAAAT TTTTCGTCAT CTTCATTGTA TTCAAAGCCC CTAATTAAGC TGTAAAAGTA 120
AATTTAATTT CTGTGAATAA CATGAACTGA AAATGGAGTT AAAATTAGAT CTTATCTTCT 180
TTAATGAACA GAAGAAAGCA CATTATTCAT CATCTGCCTC GTCGTATGCA GGAGTGTAAT 240
TTGGTGCTCA GTGGGAAACT TCAGTCCTGC CGTTTCTGCA CTCAGAGTGA TGAAGAAAAG 300
CCTGTTTATG GCATTACAGT CTGACAATAA GATGTAGAAG GTTTTTAGGG ATTGTATATA 360
ATGATTTTGT TTCCAAAAAT GACCTGTTTT TATGTAGATT TGAATTAGTT CGTCCGTCCG 420
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 480
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG 540
TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTCTC TGTCTCTCTG TCTCTCTGTC TGTCTGTCTG 600
TCTGTCTGTC TGTCTGTCTT TGTCCATTCA TGCATTCATT AATTAGTTTA ATTATTAAAT 660
TATTAAATAA TTAATTAATT AATTAATTCA TTCATTCATT CATTCATTTG TTTGTTCATT 720
CGTTCATTCA TATATTAATT AATTAAATGA TTCATTAATT AATGTATTAA ATCATTCATT 780
TACTTATTAA TCCATTCATT CTTTAATTAT TCATGCATTA ATTTATGAAT CTATTTTTCA 840
TTCATTCATT CATTCATTCA TTCATTCATT CATGTATTTA ATAATTCAGT TATTTATTAA 900
CCCATTCATT CACACATTCG ATCAAATGAA ATCCACTATG TTATCACTCT GTGTAGCATA 960
TTTTAACATT ATTTCAACCG TATTTTCATA GTTTTTCACT ATAGGAAAG 1009