EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01994 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:18725645-18727047 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:18725759-18725771GAATGTTTTTTT+6.52
Sox11MA0869.1chr12:18726199-18726214AACACTGAAATTATG-6
ZBTB7BMA0694.1chr12:18725949-18725961TTGGGTGGTCGC-6.22
Enhancer Sequence
TGGACAGGGA AAGGAGGTCA TCTAGACCGC CAACTGAATT AGCGAGCTGG AGGAGATGAG 60
TAATGAAAGG GCAACCTTGG GGAATTATGC GCATGGCAAA ATTTAAATGT CTGAGAATGT 120
TTTTTTCGCA TTCTTGTTTT TCGCGAAAGC AGGTGCAAAG GTTAAAAATG CGTCCGATTT 180
TTTCCTTGGG GAGGGATGCT TGAAATTTCT TGGAATATAG GTTAATTCCC AGTAATTCGA 240
TAGAAGTGTC AGGTCCAGAG GTTTTATCGG CGGCGAGTGG GATGTTACAG TCGGTGAAAA 300
CCTTTTGGGT GGTCGCGAGG TGTTTAGCTG GCGACGCGGA CGGAGAGGCG ATAATAAGAA 360
TGTCATACAA CAGATGAATA AGGTAAGGAA TGCCGTAATT ATTTGACAAG ATCCAGCATA 420
AGGTTTCGGA TAGCATGTAA AATATTTTAG GGCTACTTTT ACATCCGAAA GTTAAACGGA 480
CTGCGATGTA GAATTTTGAA CGCCACTGAA TGCCGAAAAG GTGCCAGAAG TCGGGGTGGA 540
TGGGCATGAT TTTGAACACT GAAATTATGT CTACTTTAGC GAGCCAAGCA TTGCAACCGG 600
CGATTTTGAT TAGGGAGATA GCTTGGTCTA TGTCGTGGTA ATTTAGAGAA AATTCATCTG 660
GCGGGATAGT GCTGTTAATG CTTGGATAGA ATGAATTATG GGGAGATGAC AGGTTGATAA 720
TTAAGCGTTT TTTACCAGAG TGTTTGCAAG TGGCAATGCC TATTGGGCTA ATTCGGTAAA 780
CGCTGAATGG AGGAGCGGAG AAAGACCCGA TCATGAAGTT ATTTTCTACT TCTTTTTTAA 840
TCAATTGATG AATGATTTCG GGCTCGGCTG TAGCGGAATG CAAATTATGG CAGAACAGAT 900
TGTAAGAAGG GAGAGCTGAA ATGCCTGGGT TGAATCCATG AGACAGACCT GAAATGAGAA 960
AATCTGAAAA ATTAGGATCA GGTTGAGCAA GTTATTCAAA AGACAGTTGA GTAATGTTGA 1020
CAAAAGTCGA AAGTTTTTTT TGATTTGTAT TATGGATTTT ACAATAGATT TTTTATTTGC 1080
TATGGATACA GGGCAGACGG TGCGCGTTTG CAGTAGTTGC AAAAGTGTAG GAATTTGCAA 1140
GGATTTCTAA AGCATCAGCC TATGTTAAAA TTTTGGAATA GAGAAGAGGA AAAAGGGGAT 1200
AGGAGAGAGG GAATGTTGAA ACTGGTGGGG TGAGGGACGT AACTTGTGGA TCTGGGAGCT 1260
GGGCTGGCTG AATCAGAAGA AGTAGTGACA AGCGGGCATG GCGTGGTTGG TTGATGTGAG 1320
GAACGGCACA CTGCGCAGGT TAGATTGCGA CATCTTAAGA ATACTCTATT GTGGAGATCT 1380
GTGTCTATAA CCCCCAGTAC AC 1402