EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-01951 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr12:13986791-13988277 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF3MA1482.1chr12:13988129-13988143CTTCCCTGGGGAAG-6.19
Foxd3MA0041.1chr12:13987273-13987285AAACAAACAATT-6.22
Foxq1MA0040.1chr12:13986848-13986859TATTGTTTATA+6.32
IRF1MA0050.2chr12:13987661-13987682AATGAGAAACTGAAAGTGTAT-7.18
Lhx3MA0135.1chr12:13987098-13987111AAATTAATTAAAT+6.07
Sox3MA0514.1chr12:13988236-13988246AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
GGCCTTTGTA AAAATTAAAG TTACATACAG TATAGCATAA AAAAGGTTTA ATTTATGTAT 60
TGTTTATACC TACATAGCTA TAGCTTTTGT TTTGTTTTTT ATATAGATTT ATTTAATTTA 120
TGTGATTTTA TTATATCCTA TATTTGTAAT TCTTTAAATT ATTTCAATAT AGCTTAGGCC 180
ATTTTATCGA GATATGCATT TGTGAGGGAC CGAGCCAGCA CGTACAGTAA GGGGCATACA 240
AAAAAGAAGA TTTTCAAAAA TAATTATTTT TAATAAAGTC AAAAAGGTTT ACAAAAAGTT 300
CAAAAATAAA TTAATTAAAT AATTAAATCA ATTGAAAGAA CAATAAACTA AACAAGGAAA 360
ACAAACTGAG TTCAAACCAA ACAAATCATG TCTAAACCAA AAACAGAACT CCATGAAATG 420
ACAAGACAGA CCACATTTAT AGCACAGGGA CTAGTCCACA TTAAACAAGA AGGGGGAGAC 480
AAAAACAAAC AATTTACAAA TACAATAAAC TAAGCCAAAC ATTTAAATAC AAATCTAAAT 540
AGAAGTTAAA GAAATTATAA ATAAGGCAAA ACTAAATATA AATCTGAATA AACAAACATT 600
GCAAATCATT ATTGAACCTA AACTAAACAT GAGCTCTCCC TCCAAGCCAT TAAGCCAATG 660
GTATCGGCAG GCGGAACCAA AAGACGGCAT CTCGCGGCAC GTCGGACCTT TACTTGGGCG 720
GACCACACCC GGAAACTGTT CCTCGTCGGC ACTGCAGCAC GGTAACTTAA ACTCAAAAGA 780
AAACTAAATT AACAAAACAT ACAGTACAGA TAACTGATTT TGTGTGCACC CAAAATAGTA 840
ATAAATGTAC TGTGAATAAT AAAGAAAGGT AATGAGAAAC TGAAAGTGTA TGAGTCTTAT 900
TTAAATCAGA TATGAATGAA ACGAAAATGT ATAAACACAA TAACTGAACT GTGACCAATA 960
AATAATCTTA AATGAATAAG TATAACGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGCGT 1020
GCATGCCTCA CTCTCAATGT GTGGCCACCA CACTGGCCAT CACATACTCC CTCCCTTCGG 1080
GAATGTCACT GGCACATCGG GACAAGTAGT CAGCCGTAAG GTTTTCTTTG CCAGGGACAT 1140
GTCTGATAAT AAACCGGAAG GGCTGCATGG CCAGGTACCA GCGGGTAATA CGACTGTTGG 1200
TATCTTTCAT TTCTTGAAGC CATTGTAGAG CTTTATGATC AGTCTCCAGT ATAAACTCCC 1260
GGCCTAGCAG ATAATACTTT AAAGAGTCCA AGGCCCACTT CACAGCCAAG CATTCCTTTT 1320
CCACAATAGA GTAGCGAACT TCCCTGGGGA AGAGCTTTCG ACTCAGGAAG GCCACTGGGC 1380
GTCGAGTGTC AGGGCTGCCC TGTAGCAATA CAGCTCCCAG GCCTCGATCT GAAGCATCAG 1440
TTTGCAAAAC AAAGGGTTGG TGGAAATCAG GGTTATGCAA GACAGA 1486